ความคล้ายคลึงของโครงสร้างถูกนำมาใช้ในการศึกษาโครงสร้างปฐมภูมิของเอนไซม์ไกลโค ซิลไฮโดรเลสจากพืชไทย โดยจากการศึกษาถึงประสิทธิภาพของเอนไซม์ไกลโคลซิลไฮโดรเลสที่มี ต่อสับสเตรทที่ให้สี เช่น พาราไนโตรฟีนิล-ไกลโคไซด์ และศึกษาถึงช่วงระยะในการเกิดปฏิกิริยา (wide range) พบว่ามีข้อจำกัดเกี่ยวกับความจำเพาะของสับสเตรท การศึกษานี้ยังได้มีการใช้ความ เหมือนกันของลำดับเบสในการการโคลนดีเอ็นเอคู่สม (cDNA) ของเบต้ากลูโคซิเดส, เบต้ากาแลค โตซิเดส, ไคติเนส และอัลฟาแมนโนซิเดสจากพืชไทยหลายชนิด ลำดับเบสของเอนไซม์จากพืชและ โปรตีนที่มีความสัมพันธ์กันถูกดึงมาจากฐานข้อมูลลำดับเบสและวิเคราะห์ด้วยโปรแกรมการจัดเรียง ลำดับเบสและทำการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมเพื่อจัดกลุ่มลำดับเปบไทด์ที่มีความ คล้ายคลึงกัน และยังทำการวิเคราะห์ลำดับเบสของเบต้ากลูโคซิเดสจากพยุง Dalbergia cochinchinensis ซึ่งได้ทำการโคลนและศึกษารูปแบบโครงสร้างโดยใช้เทคนิคการศึกษาโครงสร้าง ผลึกโดยใช้รังสีเอ็กซ์ซึ่งมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับเบต้ากลูโคซิเดส ลำดับเบสที่เหมือนกัน (conserve sequence)ถูกนำมาอ่านผันกลับเป็นลำดับของนิวคลีโอ ไทด์สายสั้นๆเพื่อใช้ในการเพิ่มปริมาณcDNAหรือชิ้นส่วนของยีนโดยวิธี PCR จากวิธีการนี้พบว่า ชิ้นส่วนของ cDNA ของเบต้ากาแลคโตซิเดส, อัลฟาแมนโนซิเดส และไคติเนส ถูกนำมาเพิ่ม จำนวน, โคลน, หาลำดับและแสดงถึงความสัมพันธ์ของเอนไซม์กลุ่มต่างๆตามที่คาดไว้ นอกจากนี้ชิ้นส่วนของยีนเบต้ากลูโคซิเดสจากมะม่วงยังได้ถูกนำมาหาลำดับและพบว่ามี ความแตกต่างของลำดับเบสในส่วนของอินทรอน ชิ้นส่วนของ cDNA ของไคติเนสที่ได้จากกระถิน บ้าน Leucaena leucocephala ถูกใช้ในการโคลนโดยวิธีการเพิ่มปริมาณ cDNA ทางด้านปลาย (RACE) และพบว่าลำดับของกรดอะมิโนของไคติเนสดังกล่าวอยู่ในคลาส Ib และมีค่า pI ประมาณ 8 A homology-based approach has been taken to identify and characterize the primary structure of glycosyl hydrolases from Thai plants. Previous studies which screened for glycosyl hydrolases using activity against colorimetric substrates, such as pNP- glycosides, identified a wide range of activities, but had some limitations. This study sought to complement this work by using sequence homology to clone cDNA for beta-glucosidase, beta-galactosidase, chitinase, and alpha-mannosidase from several Thai plant species. Known sequences for plant enzymes and related proteins were retrieved from online sequence databases and analyzed by multiple sequence alignment and phylogenetic analysis to identify conserved peptide sequences. The sequence analysis was also done for a beta-glucosidase from Dalbergia cochinchinensis, which was cloned by other methods, and a structural model was proposed based on the x-ray crystal structure of a closely related beta-glucosidase. The conserved sequences were converted to degenerate oligonucleotide sequences, which were used to amplify cDNA or gene fragments by PCR. Using this method, several beta-glucosidase, beta-galactosidase, alpha-mannosidase, and chitinase cDNA fragments were amplified, cloned, sequenced, and shown to be related to the expected enzyme families. Additionally, several beta-glucosidase gene fragments were sequenced from mango and shown to differ primarily in the intron sequence. A chitinase cDNA fragment cloned from Leucaena leucocephala de Wit. was used to clone two closely related cDNAs by a combination of rapid amplification of cDNA ends (RACE) and cDNA library screening. The deduced protein sequences were found to be class Ib (basic) chitinase precursors with projected molecular weights of approximately 32,000 and pI of 7.6 and 7.9 for the mature proteins.