การศึกษาเปรียบเทียบวิธีที่ใช้ในการวิเคราะห์เพื่อทดสอบสารที่มีฤทธิ์ยับยั้งเอนไซม์ โปรติเอสของเชื้อเอชไอวี-1 3 วิธีคือ spectrophotometry, high performance liquid chromatography (HPLC) และ sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) วิธี spectrophotometry และ HPLC ใช้ตรวจหาผลิตภัณฑ์ (Phe(NO(,2))-Glu-Ala-Nle-Ser-NH(,2)) ที่ได้จากปฏิกิริยาระหว่างเอนไซม์และสับสเตรท (His-Lys-Ala-Arg-Val-Leu-Phe(NO(,2))-Glu-Ala-Nle-Ser-NH(,2)) ส่วนวิธี SDS- PAGE ใช้ตรวจวัดความเข้มของแถบโปรตีนที่ลดลงจากปฏิกิริยาของเอนไซม์ โดยใช้น้ำหรือ dimethyl sulfoxide เป็นสารควบคุมในกรณีที่ไม่มีสารยับยั้งปฏิกิริยา และ pepstatin A เป็นสารควบคุม ในการยับยั้งปฏิกิริยา ผลการศึกษาพบว่าวิธี spectrophotometry เป็นวิธีที่เหมาะสมในการ ทดสอบเพื่อหาสารที่มีฤทธิ์ยับยั้งเอนไซม์โปรติเอสของเชื้อเอชไอวี-1 จากนั้นได้นำสารสกัดน้ำจาก พืชสมุนไพร 6 ชนิดสารสกัด ethanol ของพืชสมุนไพร 9 ชนิด ความเข้มข้น 5 ไมโครกรัมต่อ ไมโครลิตร และสารเคมีสังเคราะห์ 8 ชนิด (หมายเลข 1-8) ความเข้มข้น 20 ไมโครกรัมต่อ มิลลิลิตร มาทดสอบ ผลปรากฎว่าสารสกัดน้ำจากเหง้าพุทธรักษาและคนทีสอต้นยับยั้งปฏิกิริยาได้ 100% จากมะระขี้นกสามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้ 78.95% จากผักบุ้งขันและคนทีเขมาสามารถยับยั้ง ปฏิกิริยาได้ 57.89% จากขาไก่ขาวไม่สามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้ สารสกัด ethanol จากขาไก่ดำ ฟ้าทะลายโจร คนทีสอต้นและคนทีเขม่าสามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้ 100% จากสันโศก ผักบุ้งขัน เหง้า พุทธรักษา ใบระบาดสามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้ 78.95, 68.42, 56.52 และ 4.35% ตามลำดับ จากขาไก่ขาวไม่สามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้ ส่วนสารเคมีสังเคราะห์พบว่าสารหมายเลข 1,2,3,4,6 และ 8 สามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้ 28.57, 33.33, 88.10, 79.52, 57.14 และ 57.14% ตาม ลำดับ สารหมายเลข 5 และ 7 ไม่สามารถยับยั้งปฏิกิริยาได้