| ชื่อเรื่อง | : | การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจาก Pseudomonas maltophilia |
| นักวิจัย | : | ชมพูนุช กาญจนากร |
| คำค้น | : | CHITINASE GENE , PSEUDOMONAS MALTOPHILIA NUCLEOTIDE SEQUENCE |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2541 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=43000 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | ยีนไคติเนสจากจุลินทรีย์ Pseudomonas maltophilia ขนาด 2.0 kb ได้ถูกแยก และขยายไว้ในพลาสมิดเวคเตอร์ pBR322 จากนั้นยีนไคติเนสจากพลาสมิด pBR322 ถูกแยก และขยายในเวคเตอร์ pBluescript KS เพื่อการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ โดยได้ยีนลูกผสม p971K จากนั้นยีนลูกผสมถูกนำมาทำให้เป็นเส้นตรงโดยการตัดด้วยเอนไซม์ตัดจำเพาะ KpnI และ SalI และทำให้พลาสมิดลูกผสมมีขนาดต่างๆ กัน โดยใช้ Exonuclease III และเชื่อมสาย DNA ให้เป็นวงดังเดิม และนำพลาสมิดที่เตรียมโดยวิธี deletion method และ subcloning method มาหาลำดับนิวคลีโอไทด์ด้วยวิธี terminator cycle sequencing method โดยใช้เครื่อง automatic sequencer จากการวิเคราะห์ลำดับ นิวคลีโอไทด์โดยโปรแกรม DNASIS พบว่ายีนไคติเนสจาก Ps. maltophilia มีขนาด 2,030 bp และมี open reading frame (ORF) ขนาด 945 bp ซึ่งสามารถแปรรหัส เป็นโปรตีนขนาด 314 amino acids โดยเมื่อนำมาคำนวณหาน้ำหนักโมเลกุลแล้วพบว่า มีน้ำหนักโมเลกุล 34.43 kDa ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสมีตำแหน่งของโปรโมเตอร์ -35 (TCGGCC) และ -10 (CATAAT) ที่มีระยะห่างระหว่างกัน 25 bp. มีลำดับ นิวคลีโอไทด์ที่เป็นตำแหน่งของ Shine-Dalgano (SD) sequence (GCGGA) ที่ตำแหน่ง upstream ห่างจากรหัสเริ่มต้น ATG 12 bp และ inverted repeat sequence ที่ตำแหน่ง downstream จากรหัสหยุด (TAA) 38 bp. สายเปปไทด์ที่แปรรหัสจากลำดับนิวคลีโอไทด์ ของยีนไคติเนสพบ signal peptide ขนาด 28 amino acids บริเวณสายเปปไทด์ด้าน N-terminal. chitin binding domain ขนาด 30 amino acids และ catalytic domain ขนาด 73 amino acids จากการเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนส จาก Ps. maltophilia กับลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจากแบคทีเรียชนิดอื่นพบว่า ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจากจุลินทรีย์ Streptomyces griseus, S. lividans, S. olivaceoviridis, S. plicatus, S. thermoviolaceus และ Aeromonas sp. มีความเหมือนกับลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจาก Ps. maltophilia 55% |
| บรรณานุกรม | : |
ชมพูนุช กาญจนากร . (2541). การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจาก Pseudomonas maltophilia.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ชมพูนุช กาญจนากร . 2541. "การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจาก Pseudomonas maltophilia".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ชมพูนุช กาญจนากร . "การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจาก Pseudomonas maltophilia."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2541. Print. ชมพูนุช กาญจนากร . การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนสจาก Pseudomonas maltophilia. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2541.
|
