| ชื่อเรื่อง | : | การหาลำดับนิวคลีโอไทด์และการศึกษาการแสดงออกของยีนไคติเนสจากเชื้อ ~iBacillus circulans~i No.4.1 ใน ~iEscherichia coli.~i |
| นักวิจัย | : | อาพันธ์ชนิด เทพอวยพร |
| คำค้น | : | CHITINASE GENE , ~iBACILLUS CIRCULANS~i NO .4.1 , NUCLEOTIDE SEQUENCE , EXPRESSION |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2542 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=43388 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | ยีนไคติเนสจากเชื้อ ~iBacillus circulans~i ได้ถูกแยกและศึกษาการแสดงออกของยีนใน เชื้อ ~iEscherichia coli~i พบว่ายีนไคติเนสมี 1 open reading frame (ORF) ขนาด 1,794 bp ซึ่งสามารถแปรรหัสเป็นโปรตีนขนาด 598 amino acids โดยเมื่อนำมาคำนวณหาน้ำหนักโมเลกุล มี ขนาด 65.7 kDa amino acid ประกอบด้วย G+C เท่ากับ 45.57 %mol และ A+T เท่ากับ 56.37 %mol ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไคติเนส มีตำแหน่งโปรโมเตอร์ -35 (TGCAGC) และ -10 (TATAAA) ที่มีระยะห่างกันระหว่าง 21 bp มีลำดับนิวคลีโอไทด์ที่เป็นตำแหน่งของ Shine-Dalgano (SD) sequence (GAAAA) ที่ตำแหน่ง upstream ห่างจากรหัสเริ่มต้น ATG 5 bp และตำแหน่งรหัสหยุด โดยพบ signal peptide ขนาด 35 amino acids ที่มีกรดอะมิโนเป็น recognition sequence สำหรับ signal peptidase ด้วยคือ Ala-X-Ala ยีนไคติเนสถูกขยายไว้ในพลาสมิดเวคเตอร์ pHY300PLK, pKK223-3 และ pBluescript II KS (-/+) โดยได้ยีนลูกผสม pHY43, pKK43 และ pKS43 ตามลำดับ ศึกษาในส่วน C-terminal และ N-terminal โดยตัดทอนนิวคลีโอไทด์ทั้ง 2 ข้างจาก พลาสมิดตั้งต้น pCHI43 ทำให้ได้พลาสมิดใหม่ คือ pC66, pC6S, pSS6 และ pEVS ซึ่งพบว่า การตัดทอนด้าน C-terminal ของยีนไม่มีผลต่อการแสดงออกของยีนต่อ soluble chitin [4-MU (GlcNAc)(,2), glycol chitin] แต่ไม่สามารถย่อย insoluble chitin [colloidal chitin] ฉะนั้นคาดว่าในส่วน C-terminal จะประกอบด้วย chitin binding domain ที่มีความจำเพาะต่อ การจับ chitin โดยพบ 40 amino acids ที่ conserve chitin binding domain นิวคลีโอไทด์ และ 57 amino acids ที่เป็น conserve catalytic domain นิวคลีโอไทด์ การแสดงออกของยีน ถูกตรวจสอบด้วย 4-methylumbelliferyl (+,b)-D,~iN,N~idiacetyl chitobioside ภายหลังจาก การแยกโปรตีนด้วย SDS-PAGE และหาระดับการสร้างเอนไซม์ในแต่ละพลาสมิดพบว่า สูงสุด 60.80 mU/mg ใน pCHI43, ส่วนใน pHY43, pKK43, pKS43, pC66, pC6S, pSS6 และ pEVS มีระดับของ เอนไซม์ 28.49 mU/mg, 19.54 mU/mg, 3.70 mU/mg, 22.53 mU/mg, 36.10 mU/mg, 5.02 mU/mg, 0.96 mU/mg ตามลำดับ |
| บรรณานุกรม | : |
อาพันธ์ชนิด เทพอวยพร . (2542). การหาลำดับนิวคลีโอไทด์และการศึกษาการแสดงออกของยีนไคติเนสจากเชื้อ ~iBacillus circulans~i No.4.1 ใน ~iEscherichia coli.~i.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. อาพันธ์ชนิด เทพอวยพร . 2542. "การหาลำดับนิวคลีโอไทด์และการศึกษาการแสดงออกของยีนไคติเนสจากเชื้อ ~iBacillus circulans~i No.4.1 ใน ~iEscherichia coli.~i".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. อาพันธ์ชนิด เทพอวยพร . "การหาลำดับนิวคลีโอไทด์และการศึกษาการแสดงออกของยีนไคติเนสจากเชื้อ ~iBacillus circulans~i No.4.1 ใน ~iEscherichia coli.~i."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2542. Print. อาพันธ์ชนิด เทพอวยพร . การหาลำดับนิวคลีโอไทด์และการศึกษาการแสดงออกของยีนไคติเนสจากเชื้อ ~iBacillus circulans~i No.4.1 ใน ~iEscherichia coli.~i. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2542.
|
