Pseudomonas ในกลุ่ม ribotype I เช่น P. aeruginosa, P. putida, P. stuzeri, P. fluorescens etc. เป็นแบคทีเรียที่ก่อให้เกิดโรคในคน สัตว์ และ พืช เช่นเดียวกับแบคทีเรีย ในกลุ่ม ribotype II ซึ่งปัจจุบันได้ถูกจำแนกให้เป็น Burkholderia เช่น B. pseudomallei, B. cepacia, B. pickettei เป็นต้น ก็เป็นสาเหตุของโรคทั้งในคน สัตว์ และ พืช จากการศึกษามีผู้ รายงานถึงปัจจัยที่ทำให้เกิดพยาธิสภาพของโรคโดยเชื้อ P. aeruginosa และ B. pseudomallei มีหลายประการได้แก่ โปรตีนหรือสารพิษที่แบคทีเรียหลั่งออกมา โครงสร้างที่ช่วยให้การยึด เกาะของแบคทีเรีย เช่น Pili และโครงสร้างที่ทำให้เคลื่อนที่ได้ คือ แฟคจิลา (flagella) ซึ่งมี องค์ประกอบส่วนใหญ่เป็นโปรตีนแฟคจิลิน จากการศึกษาในแบคทีเรียหลายชนิดพบว่าแฟคจิลา มีบทบาทที่น่าสนใจต่อพยาธิสภาพของจุลชีพเหล่านั้น โดยอาศัยเทคนิคพีซีอาร์ซึ่งได้พัฒนา จากงานวิจัยของกลุ่มเอง พบว่าสามารถออกแบบไพรเมอร์ที่จำเพาะเพื่อขยายยีนแฟคจิลินของ สายพันธุ์ต่างๆในแบคทีเรียกลุ่ม Pseudomonas และสามารถออกแบบไพรเมอร์ที่จำเพาะเพื่อ ขยายยีนแฟคจิลินของสายพันธุ์ต่างๆในแบคทีเรียกลุ่ม Burkholderia จากการศึกษาลำดับเบส ของยีนดังกล่าวนี้สามารถสรุปได้ดังนี้ (1) แฟคจิลินยีนในสายพันธุ์ที่ใกล้เคียงกันคือ Pseudomonas เช่น P. aeruginosa, P. putida, P. stuzeri, P. fluorescens จะมีลำดับกรดอะมิ โนที่ปลาย N- และ C- ใกล้เคียงกันมากกว่าสายพันธุ์ที่ห่างออกไป เช่นเดียวกัน Burkholderia เช่น B. pseudomallei, B. cepacia, จะมีลำดับกรดอะมิโนที่ปลาย N- และ C- ใกล้เคียงกันมาก กว่าสายพันธุ์ Pseudomonas (2) ขนาดของยีนในกลุ่ม Pseudomonas มีความแตกต่างกันมาก ในขณะที่กลุ่ม Burkholderia ขนาดของยีนใกล้กันมาก (3) ส่วนของความผันแปรในกลุ่ม Pseudomonas มีความผันแปรสูงมากทั้งที่เป็นสายพันธุ์เดียวกันแต่นำมาจากคนละแหล่ง ขณะ ที่ Burkholderia มีความผันแปรในยีนน้อยมากโดยเฉพาะ B. pseudomallei ส่วน B. cepacia จะมียีน 2 ชนิดที่มีขนาดแตกต่างกัน แต่ชนิดที่พบในคนไข้หรือชนิดที่ก่อโรคในคนเป็นขนาด 1.1 กิโลเบส (4) ในกลุ่ม Burkholderia ที่แยกเชื้อจากผู้ป่วยจะพบขนาดของยีนที่ 1.1 กิโลเบส แต่สามารถใช้วิธีการ PCR-RFLP และ PCR ที่ใช้ไพรเมอร์จำเพาะ ในการแยกชนิดของเชื้อ ระหว่าง B. pseudomallei และ B. cepacia, B. thailandensis ได้ (B. thailandensis เดิมถูก จัดเป็น B. pseudomallei ที่ไม่ก่อโรค มีคุณสมบัติเป็น Ara+) จากข้อมูลที่ได้นี้ก่อให้เกิดข้อสังเกตุที่น่าจะเป็นประโยชน์และน่าสนใจคือความผันแปร ของยีนแฟคจิลิน น่าจะมีความสัมพันธ์กับการกระจายตัวของเชื้อแบคทีเรีย ทั้งนี้ B. pseudomallei เป็นแบคทีเรียที่มีการกระจายตัวของเชื้อที่แคบมาก พบเฉพาะในประเทศทาง Southeast Asia เมื่อเทียบกับ B. cepacia ที่พบทั่วไปในหลายทวีป นอกจากนี้ลำดับเบสที่พบ ระหว่าง B. pseudomallei และ B. thailandensis ซึ่งมีลำดับกรดอะมิโนต่างกัน15 อะมิโนอย่าง มีนัยสำคัญบริเวณกลางยีน ซึ่งสัมพันธ์กับความสามารถในการใช้ arabinose น่าจะเป็นผลจาก สิ่งแวดล้อมต่อความผันแปรของยีนแฟคจิลินเช่นเดียวกัน P. aeruginosa, P. putida, P. stuzeri, P. fluorescens are pathogenic bacteria in the genus Pseudomonas ribotype I. Burkholderia [1] e.g. B. pseudomallei, B. cepacia, B. pickettei are previously classified in the genus of Pseudomonas ribotype II. Both ribotypes are pathogen in human, animal and plant. It has been studied that pathogenesis of these bacteria came from many factors. One of virulent factors is flagella which involved in motility of bacteria. Flagella is consisted mainly of protein subunit called flagellin. Since, our group has developed the PCR-base method for isolation of flagellin gene sequences, this can increase possibility to study a large number of flagellin gene in molecular level. Under PCR-condition, a set of primers was designed at the N- and C- conserved regions. It was found that these two ribotypes composed of different conserved sequences. Therefore, we have to design two different set of primers, one is suitable for genus Pseudomonas, and the other is used for genus Burkholderia. The results from our study can be concluded as follows : (1) flagellin gene sequences among the same genus are highly conserved than across the genus, but it is still showed a characteristic of flagellin structure (2) flagellin gene sizes in genus Pseudomonas are more diverse than in genus Burkholderia (3) the variable region among flagellin gene sequences in genus Pseudomonas are higher variable than genus Burkholderia (4) since, flagellin gene sizes in genus Burkholderia among B. pseudomallei, B. cepacia and B. thailandesis are similar size of about 1.1 kb, we therefore developed PCR-RFLP analysis and PCR with specific primers for differentiation among B. pseudomallei, B. cepacia and B. thailandesis (is very similar to B. pseudomallei but B. thailandesis is arabinose assimilator). In this study, sequence conservation among species of Burkholderia is more stable than of Pseudomonas and among isolates of B. pseudomallei is also more striking than in strains of B. cepacia or species of Pseudomonas. This may be related to bacterial distribution and environmental condition. B. pseudomallei distribute in a narrow geographic area and it is arabinose non-assimilator.