ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมในเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธีสุ่มขยาย ปริมาณดีเอ็นเอ

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมในเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธีสุ่มขยาย ปริมาณดีเอ็นเอ
นักวิจัย : วสุ ปฐมอารีย์
คำค้น : 99 P.
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2542
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=28966
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธี สุ่มขยายปริมาณดีเอ็นเอ ได้ศึกษาในเชื้อน้ำส้มสายชูที่แยกจากผลไม้ชนิดต่าง ๆ ในประเทศไทย จำนวน 129 ไอโซเลตและสายพันธุ์ญี่ปุ่นจำนวน 14 สายพันธุ์ ซึ่งได้แบ่งออกเป็น 2 กลุ่มคือ เชื้อกลุ่มที่ทนและไม่ทนอุณหภูมิสูง จากการตรวจสอบความสามารถในการเจริญของเชื้อบนอาหาร แข็งที่อุณหภูมิ 40 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 3 วัน พบว่าเชื้อน้ำส้มสายชูสายพันธุ์ไทยและ ญี่ปุ่นที่สามารถเจริญได้ภายใต้สภาวะนี้มีจำนวนทั้งสิ้น 107 ไอโซเลตและ 7 สายพันธุ์ตาม ลำดับ จากการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมโดยวิธีสุ่มขยายปริมาณดีเอ็นเอของเชื้อ น้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูง พบว่าสภาวะที่เหมาะสมสำหรับการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอคือ ส่วน ผสมในปฏิกิริยา (ปริมาตรรวม 20 ไมโครลิต) ประกอบด้วยบัฟเฟอร์ (Tris-HCl pH 8.3 ความเข้ม ข้น 100 มิลลิโมล และ KCl 500 มิลลิโมล), dNTP 200 ไมโครโมล, MgCl(,2) 4.0 มิลลิโมล, ไพรเมอร์ 1 พิโคโมล, ดีเอ็นเอต้นแบบ 10 นาโนกรัมและเอนไซม์ AmpliTaq Gold 1 ยูนิต โดย ตั้งโปรแกรมเครื่องพีซีอาร์ที่อุณหภูมิ 95 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 12 นาที จำนวน 1 รอบ ตามด้วย 45 รอบที่อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 1 นาที, อุณหภูมิ 36 องศาเซลเซียส นาน 2 นาที และอุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส นาน 3 นาที แล้วสิ้นสุดปฏิกิริยาด้วยขั้นตอน final extension ที่ อุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 10 นาที จากการทดลองกับไพรเมอร์จำนวน 51 ไพรเมอร์พบว่าไพรเมอร์ AD01 (5 -CAAAGGGCGG-3) สามารถแยกความหลากหลายทางพันธุกรรม ของเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงออกได้เป็น 18 กลุ่ม ซึ่งกลุ่มที่น่าสนใจที่สุดได้แก่ เชื้อในกลุ่ม IX ที่ประกอบด้วยสมาชิก 13 ไอโซเลตที่ให้แถบดีเอ็นเอขนาด 0.6, 1.0 และ 1.3 กิโลเบส จากการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของชิ้นดีเอ็นเอขนาด 0.6 และ 1.0 กิโลเบส ปรากฏ ว่าประกอบด้วย บริเวณที่สามารถแปลรหัสเป็นโปรตีนที่มีบางส่วนคล้ายคลึงกับโปรตีนขนส่งใน เยื่อหุ้มเซลล์ของเชื้อ Escherichia coli สายพันธุ์ K12 นอกจากนี้ผลการวิเคราะห์ hydropathy profile ของโปรตีนทั้งสองบ่งชี้ว่าโปรตีนทั้งสองน่าจะทำหน้าที่เป็นโปรตีนองค์ ประกอบของเยื่อหุ้มเซลล์ สำหรับชิ้นดีเอ็นเอขนาด 1.3 กิโลเบสนั้น พบว่าบริเวณที่สามารถ แปลรหัสออกมาเป็นโปรตีนที่ละลายน้ำได้ แต่ไม่พบความคล้ายคลึงกันระหว่างโปรตีนนี้กับโปรตีน ใด ๆ ที่เคยมีผู้รายงานไว้ในฐานข้อมูล จึงยังไม่สามารถระบุหน้าที่ของโปรตีนนี้ได้

บรรณานุกรม :
วสุ ปฐมอารีย์ . (2542). การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมในเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธีสุ่มขยาย ปริมาณดีเอ็นเอ.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
วสุ ปฐมอารีย์ . 2542. "การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมในเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธีสุ่มขยาย ปริมาณดีเอ็นเอ".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
วสุ ปฐมอารีย์ . "การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมในเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธีสุ่มขยาย ปริมาณดีเอ็นเอ."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2542. Print.
วสุ ปฐมอารีย์ . การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมในเชื้อน้ำส้มสายชูที่ทนอุณหภูมิสูงโดยวิธีสุ่มขยาย ปริมาณดีเอ็นเอ. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2542.