จากการศึกษาดูผลของ gemfibrozil ต่อการทำงานของไมโตคอนเดรียที่แยกจากตับหนูขาวพบว่า gemfibozil มีผล 2 แบบต่อการหายใจไมโตคอนเดรีย คือ แบบที่ 1 gemfibrozil ออกฤทธิ์เป็น classicaluncoupler กระตุ้นการหายใจ state 4 และกระตุ้นการทำงานของเอนไซม์ ATPase ของไมโตคอนเดรีย แบบที่ 2 gemfibrozil ออกฤทธิ์ยับยั้งการขนส่งอิเลคตรอนที่ complex I ของลูกโซ่การหายใจ ทำให้การหายใจstate 3 และ 3u ของไมโตคอนเดรียมีอัตราลดลง เป็นผลให้การควบคู่กันระหว่างกระบวนการออกซิเดชั่นและกระบวนการฟอสฟอริเลชั่นเสียไปและทำให้ความสามารถในการสังเคราะห์ ATP ของไมโตคอนเดรียลดลง การที่gemfibrozil ทำให้การสังเคราะห์ ATP ในตับลดลงอาจเกี่ยวข้องกับกลไกการออกฤทธิ์ของยาในระดับโมเลกุลนอกจากนี้ยังพบว่า gemfibrozilกระตุ้นการปลดปล่อยแคลเซียมออกจากไมโตคอนเดรีย แต่ไม่มีผลต่อ activityของเอนไซม์ monoamine oxidase การใช้ gemfibrozil ติดต่อกันเป็นระยะเวลานานอาจก่อผลไม่พึงประสงค์ต่อการทำงานของตับเนื่องจากระดับของ ATP ภายในเซลล์ลดลง