ไวรัสไข้สมองอักเสบ (Japanese encephalitis virus) เป็นไวรัสตัวการที่ทำให้ เกิดโรคไข้สมองอักเสบซึ่งถูกจัดอยู่ในกลุ่ม Flavivirus ที่มียุงเป็นพาหะนำโรค ไข้สมองอักเสบดังกล่าวก่อให้เกิดปัญหาสำคัญต่อวงการสาธารณสุขในหลายประเทศ ในแถบ ภูมิภาคเอเซีย ปัจจุบันนี้ยังไม่มียารักษาที่จำเพาะต่อโรคนี้ อย่างไรก็ดี มีวัคซีนป้องกันโรค ดังกล่าวอยู่สามชนิด จำหน่ายในท้องตลาด วัคซีนทั้งสามชนิดนี้ได้แก่ วัคซีนที่ผลิต จากเชื้อที่ตายแล้วซึ่งได้จากการเพาะเลี้ยงในสมองหนู (inactivated vaccine derived from mouse brain tissue) วัคซีนที่ผลิตจากเชื้อที่ตายแล้ว ที่เพาะเลี้ยงในเซลล์ จากไตของหนูแฮมสเตอร์ (inactivated vaccine derived from primary hamster kidney cell) และวัคซีนที่ทำจากเชื้อที่ยังเป็นแต่อ่อนความรุนแรงลง ซึ่งทำจากไวรัส ไข้สมองอักเสบสายพันธุ์ SA-14-14-2 (live attenuated SA-14-14-2 vaccine). สามารถคัดเลือกเชื้อไวรัสไข้สมองอักเสบที่มีคุณสมบัติทำให้เกิด plaque ขนาดเล็ก (small plaque) ได้ห้าสายพันธุ์ที่มีคุณสมบัติที่ทำให้เกิด small plaque จากไวรัสไข้สมองอักเสบสายพันธุ์ KE-093 ที่เพาะเลี้ยงในเซลล์ BHK-21 โดยการทำ แยกเชื้อให้บริสุทธิ์ด้วยวิธี plaque purification technique และเปลี่ยนอุณหภูมิ ให้สูงขึ้น พบว่า plaque ที่เกิดจากสายพันธุ์เหล่านี้ มีขนาดเล็กลงและ ลักษณะของ plaque จะคงตัวเหมือนเดิมจนถึง passage ที่สิบที่อุณหภูมิ 40 องศาเซลเซียส เมื่อ ทำการตรวจสอบโดยดูการเจริญของเชื้อที่คัดเลือกได้พบว่า 3 สายพันธุ์มีความสามารถใน การเจริญของเชื้อลดลงในที่ที่มีอุณหภูมิสูงและ 2 สายพันธุ์มีความสามารถเจริญได้ดีในที่ ที่มีอุณหภูมิสูง เมื่อเปรียบเทียบกับเชื้อสายพันธุ์แม่ (wild type) ที่ใช้เริ่มต้น จากการศึกษาคุณลักษณะของเชื้อพบว่า เชื้อที่คัดเลือกได้มีลักษณะที่แตกต่างไปจาก เชื้อสายพันธุ์ wild type ทั้งการเจริญและลักษณะของ plaque ที่ได้ Small plaque variants ที่ได้นี้ อาจสามารถนำไปพัฒนาเป็นวัคซีนป้องกันโรค ไข้สมองอักเสบได้ในอนาคต แต่อย่างไรก็ตามจะต้องศึกษาการก่อโรค (pathogenicity) และลักษณะทาง genetics ของเชื้อให้ดีเสียก่อน