ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การวิเคราะห์ยีโนม และการแสดงออกของไกลโคโปรตีนลูกผสมขนาด 116 กิโลดาลตันของไวรัสหัวเหลือง

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การวิเคราะห์ยีโนม และการแสดงออกของไกลโคโปรตีนลูกผสมขนาด 116 กิโลดาลตันของไวรัสหัวเหลือง
นักวิจัย : นุสรา สิทธิดิลกรัตน์
คำค้น : YELLOW HEAD VIRUS , GENOME , GP 116 , GLYCOPROTEIN , NIDOVIRALES , TAXONOMY
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2545
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=46341
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

งานวิจัยนี้ได้ทำการศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์จำนวน 15,096 เบสของไวรัสหัวเหลือง ซึ่งเป็นอาร์เอ็นเอเส้นบวก สายเดี่ยว พบว่าบริเวณดังกล่าวคิดเป็นจำนวน 57% ของยีโนม โดยนับจากปลาย 3 เมื่อนำมาเปรียบเทียบกับไวรัส GAV จากประเทศออสเตรเลีย พบว่า บริเวณที่ทำการศึกษาประกอบด้วย open reading frame จำนวน 5 ท่อน ได้แก่ ORF1a, ORF1b, ORF2, ORF3 และ ORF4 โดยส่วนหนึ่งของ ORF1a ที่ทำการศึกษามีขนาด 268 เบส และมี ลำดับเบสคาบเกี่ยวกับ ORF1b จำนวน 37 เบส ผลการวิเคราะห์ลำดับเบสส่วนที่คาบเกี่ยว สามารถนำมาทำนายโครงสร้างของลำดับเบสจำนวน 131 เบส ที่มีการฟอร์มเป็น RNA pseudoknot และมีตำแหน่งอยู่ถัดจาก slippery sequence (AAAUUUU) ซึ่งเป็นตำแหน่งที่ช่วยให้เกิด ขบวนการ ribosomal frameshift ทำให้ได้โพลีโปรตีน ORF1 จากกรดอะมิโน จำนวน 2,616 ตัว (299,322 ดาลตัน) ซึ่งเป็นโปรตีนที่มีความสำคัญต่อขบวนการสร้างอาร์เอ็นเอ และเป็น ลักษณะจำเพาะที่สำคัญของไวรัสในกลุ่ม nidoviruses ORF2 มีลำดับนิวคลีโอไทด์จำนวน 441 เบส ผลิตโปรตีนที่ประกอบด้วยกรดอะมิโน 146 ตัว มีขนาด 16,325 ดาลตัน และเป็นนิวคลีโอโปรตีน ORF3 มีลำดับนิวคลีโอไทด์จำนวน 5,001 เบส ผลิตโพลีโปรตีนที่ประกอบด้วยกรดอะมิโน 1,666 ตัว มีขนาด 185,713 ดาลตัน ซึ่งถูกย่อยต่อได้โปรตีนโครงสร้าง 2 ขนาด ได้แก่ gp116 และ gp64 พบว่าโปรตีนลูกผสม gp116 ที่ได้จากการตัดส่วน transmembrane ทางปลาย 3 สามารถทำปฏิกิริยากับโพลีโคลนอล แอนติบอดี้ที่เตรียมจากไวรัสหัวเหลืองบริสุทธิ์ได้ ORF4 มีขนาดเล็กมาก (63 เบส) และอาจ ทำหน้าที่ผลิตโปรตีนที่ประกอบด้วยกรดอะมิโนเพียง 20 ตัวเท่านั้น อย่างไรก็ดียัง ไม่แน่ชัดว่ามีการแสดงออกของยีนจาก ORF4 ในเซลล์ที่มีการติดเชื้อหรือไม่ ลำดับเบสบริเวณ non-coding ที่อยู่ด้านหน้าของ ORF2 (352 เบส) และ ORF3 (54 เบส) ของไวรัสหัวเหลืองมีลักษณะเหมือนกับลำดับเบสแบบอนุรักษ์ที่ปลาย 5 (5-ACAACC) บนสาย mRNA ของไวรัส GAV แสดงให้เห็นว่าการแสดงออกของยีนในไวรัสหัวเหลืองเกิดขึ้น เหมือนกับไวรัส GAV ในลักษณะ nested set ของ subgenomic mRNAs ข้อมูลดังกล่าวเป็นการ ชี้ว่าไวรัสหัวเหลืองได้ถูกจัดอยู่ในจีนัสใหม่ ~iOkavirus~i และแฟมิลี่ใหม่ ~iRoniviridae~i ภายใต้ออเดอร์ ~iNidovirales~i และยังเป็นข้อมูลพื้นฐานที่สำคัญ ต่อการศึกษาเกี่ยวกับโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีนของไวรัสหัวเหลืองในอนาคต

บรรณานุกรม :
นุสรา สิทธิดิลกรัตน์ . (2545). การวิเคราะห์ยีโนม และการแสดงออกของไกลโคโปรตีนลูกผสมขนาด 116 กิโลดาลตันของไวรัสหัวเหลือง.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
นุสรา สิทธิดิลกรัตน์ . 2545. "การวิเคราะห์ยีโนม และการแสดงออกของไกลโคโปรตีนลูกผสมขนาด 116 กิโลดาลตันของไวรัสหัวเหลือง".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
นุสรา สิทธิดิลกรัตน์ . "การวิเคราะห์ยีโนม และการแสดงออกของไกลโคโปรตีนลูกผสมขนาด 116 กิโลดาลตันของไวรัสหัวเหลือง."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2545. Print.
นุสรา สิทธิดิลกรัตน์ . การวิเคราะห์ยีโนม และการแสดงออกของไกลโคโปรตีนลูกผสมขนาด 116 กิโลดาลตันของไวรัสหัวเหลือง. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2545.