| ชื่อเรื่อง | : | การศึกษาความผิดปรกติในระดับอณูของยีน PKD1 ในครอบครัวผู้ป่วยไทยโรคไตเป็นถุงน้ำชนิด autosomal dominant |
| นักวิจัย | : | วรรณา ทองนพคุณ |
| คำค้น | : | long RT-PCR , MRF-SSCP , mutation , PKD1 , Thai , คนไทย , มิวเตชั่น , โรคไตเป็นถุงน้ำชนิดเด่น |
| หน่วยงาน | : | สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2548 |
| อ้างอิง | : | http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=PDF4480036 , http://research.trf.or.th/node/3219 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | งานวิจัยนี้เป็นการศึกษามิวเตชั่นที่ยืน PKD1 ซึ่งเป็นสาเหตุร้อยละ 85 ของโรคไตเป็นถุงน้ำชนิดที่มีการถ่ายทอดทางพันธุกรรมแบบลักษณะเด่น โครงสร้างอันซับซ้อนของยีน PKD1 ซึ่งมีขนาดใหญ่และมีลำดับเบสส่วนใหญ่ที่ถูกลอกเลียนโดยยีนอื่นไม่น้อยกว่า 6 ยีนทำให้การวิเคราะห์ความผิดปรกติในยีนนี้ทำได้ยาก การที่มิวเตชั่นในยีน PKD1 มีความหลากหลายอย่างยิ่งทำให้ต้องพิสูจน์หาชนิดของมิวเตชั่นเท่าที่เป็นไปได้ในยีนนี้ในประชากรเชื้อชาติต่างๆ รวมทั้งคนไทยซึ่งยังมีข้อมูลนี้อยู่น้อย คณะผู้วิจัยได้เคยพัฒนาเทคนิค long reverse transcription-polymerase chain reaction ( long RT-PCR )เพื่อใช้ศึกษาเรื่องนี้โดยการเพิ่มจำนวนชุดของลำดับเบสที่จำเพาะต่อยีน PKD1 ตลอดทั้งยีนในระดับอาร์เอ็นเอ ( ขนาด 13.6 กิโลเบส ) งานวิจัยนี้ได้นำเทคนิคดังกล่าวมาใช้ร่วมกับวิธี multiple-strand conformation polymorphism ( MRF-SSCP ) analysis เพื่อใช้ตรวจกรองหามิวเตชั่นของยีน PKD1 ใน cDNA ที่มีขนาดยาว การวิเคราะห์ลำดับเบสได้ทำทั้งใน cDNA และดีเอ็นเอจากจีโนมที่จำเพาะต่อยีน PKD1 จากการศึกษาในผู้ป่วยจากต่างครอบครัว 20 ราย ผู้วิจัยได้ตรวจพบมิวเตชั่น 6 ชนิด ได้แก่ splicing mutation 2 ชนิด(IVS13-2A>T) และ g.33184-33214del31 ), nonsense mutation 1 ชนิด ( Q1828X ), frameshift deletion 2 ชนิด ( c.5225_5226delAG และ c.9451_9452delAT ) และ inframe deletion 1 ชนิด ( L3287del ) มิวเตชั่น 3 ชนิดในจำนวนนี้ไม่เคยมีรายงานมาก่อน และมีมิวเตชั่นที่เกิดขึ้นใหม่ ( de novo mutation ) ในครอบครัว 2 ครอบครัวซึ่งแสดงถึงอัตราการเกิดมิวเตชั่นที่สูงในยีนนี้ จากข้อมูลนี้ยังไม่พบความสัมพันธ์ระหว่างอาการแสดงของโรคกับชนิดหรือบริเวณของยีนที่เกิดมิวเตชั่นและยังต้องการการศึกศสเพิ่มเติมอีกเพื่อเป็นฐานข้อมูลให้เข้าใจกลไกการเกิดโรคที่ระดับโมเลกุลต่อไป ผลการศึกษานี้เป็นประโยชน์เบื้องต้นต่อการวินิจฉัยโรคในแง่ต่างๆ อาทิ การวินิจฉัยแยกโรค การวินิจฉัยโรคก่อนมีอาการ การพยากรณ์โรค และการตัดสินเลือกผู้บริจาคไตให้ผู้ป่วย This research aims to study mutations in the PKD1 gene which are the major cause of autosomal dominant polycystic kidney disease(ADPKD), accounting for 85% of cases. The complicated structure of this large gene that has been copied by at least 6 homologous genes has made difficulty in its molecular study. Extremely heterogeneous nature of PKD1 mutations requiresidentification of all possibilities in various races including Thai population whose little data has been obtained. Our group has recently developed long reverse transcription-polymerase chain reaction (long RT-PCR) techniques for PKD1-mutation study by selective amplification of the full-length PKD1 transcripts(13.6 kb). The strategy was applied, in this study, together with multiple restriction fragment-single strand conformation polymorphism (MRP-SSCP) for mutation screening in long segments of PKD1-cDNA. Sequence analyses were performed in both cDNA and genomic-DNA specific for PKD1. Upon analysis of 20 unrelated patients, we have identified 6 disease-causing mutations, three of which are novel, in 6 families: 2 splicing mutations (IVS13-2A>T and g.33184-33214del31),1 nonsense mutation (Q1828X), 2 frameshift deletions ((c.5225_5226delAG and c.9451_9452delAT) and 1 in-frame deletion (L3287del). De novo mutations were found in 2 families, stressing the high mutation rate of this gene. More numbers of identified PKD1 mutations would make a possibility ot correlate the genotype with the disease phenotype that could give insight to understand the disease mechanism at the molecular level. Immediate advantages of mutation identifications in PKD1 are for diagnostic purposes including the differential diagnosis, presymtomatic testing, prognostic implications (PKD1 or PKD2) and determination of living related kidney donor. |
| บรรณานุกรม | : |
วรรณา ทองนพคุณ . (2548). การศึกษาความผิดปรกติในระดับอณูของยีน PKD1 ในครอบครัวผู้ป่วยไทยโรคไตเป็นถุงน้ำชนิด autosomal dominant.
กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย. วรรณา ทองนพคุณ . 2548. "การศึกษาความผิดปรกติในระดับอณูของยีน PKD1 ในครอบครัวผู้ป่วยไทยโรคไตเป็นถุงน้ำชนิด autosomal dominant".
กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย. วรรณา ทองนพคุณ . "การศึกษาความผิดปรกติในระดับอณูของยีน PKD1 ในครอบครัวผู้ป่วยไทยโรคไตเป็นถุงน้ำชนิด autosomal dominant."
กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2548. Print. วรรณา ทองนพคุณ . การศึกษาความผิดปรกติในระดับอณูของยีน PKD1 ในครอบครัวผู้ป่วยไทยโรคไตเป็นถุงน้ำชนิด autosomal dominant. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2548.
|
