| ชื่อเรื่อง | : | ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเห็ดโคน ~iTermitomyces sp.~i บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ลำดับพันธุกรรมบริเวณไอทีเอส |
| นักวิจัย | : | ศจิษฐา ประเสริฐกุล |
| คำค้น | : | ITS , TERMITOMYCES , TERMITE , SEQUENCE |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2547 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1082547001000 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | สำรวจและเก็บตัวอย่างเห็ดโคน ~iTermitomyces sp.~i จากแหล่งที่พบเห็ดโคนมาก และมีชื่อเสียงในจังหวัดกาญจนบุรี และบุรีรัมย์ รวม 18 พื้นที่ พร้อมศึกษาลักษณะสัณฐานวิทยาประกอบการศึกษาทางชีววิทยาโมเลกุลจากลำดับสารพันธุกรรมพบว่าสามารถแบ่งตัวอย่างออกเป็น 5 กลุ่มย่อย ได้แก่ ~iTermitomyces clypeatus~i R. Heim ~iTermitomyces aurantiacus Termitomyces entolomoides Termitomyces striatus~iและ ~iTermitomyces globulus~i เมื่อนำตัวอย่างมาสกัดดีเอ็นเอโดยวิธี CTAB ได้ดีเอ็นเอบริสุทธิ์ที่มีค่าสัดส่วน OD 260/280 อยู่ในช่วง 1.7-1.9 การเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอในบริเวณ ITS โดยใช้คู่ไพรเมอร์ ITS4 และ ITS5 ได้ผลิตภัณฑ์ดีเอ็นเอขนาดประมาณ 638.94 นิวคลีโอไทด์ใน 17 จาก 18 ตัวอย่าง และได้ดีเอ็นเอขนาด 948 นิวคลีโอไทด์ 1 ตัวอย่าง ที่ได้จากจังหวัดบุรีรัมย์ ชิ้นส่วนดีเอ็นเอดังกล่าวเมื่อนำไปโคลนเข้าสู่พลาสมิด pCR II ด้วยเทคนิค TA Cloning สามารถคัดเลือกแบคทีเรียต้านทานยาปฏิชีวนะได้ไม่น้อยกว่า 60 โคโลนีต่อชนิดตัวอย่าง ซึ่งสามารถตรวจสอบชิ้นดีเอ็นเอที่โคลนได้ จากการตรวจสอบพลาสมิดด้วยชุดตรวจสอบ Direct two view การสกัด DNA small scaleplasmid preparation และการเพิ่มปริมาณชิ้นดีเอ็นเอด้วยเทคนิค PCR ได้ตัวอย่างละ 3 โคโลนี เมื่อนำไปวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์พบว่าดีเอ็นเอบริเวณ ITS ในกลุ่มแรกมีขนาด 623-646 นิวคลีโอไทด์และในกลุ่มที่ 2 มีขนาด 948 นิวคลีโอไทด์ ผลการเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์รวมพบว่าลำดับที่พบในเห็ดโคนของประเทศจับกลุ่มและมีความแตกต่างของเห็ดที่พบในต่างประเทศ เมื่อนำไปวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม พบว่าเห็ดโคนตัวอย่างที่ศึกษามีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมในกลุ่มย่อย 5 กลุ่ม และแตกต่างทางพันธุกรรมจากตัวอย่างที่รายงานในต่างประเทศโดยมีผลการวิเคราะห์ตัวอย่าง ~iT.entolomoides~i และ ~iT.clypeatus~i สอดคล้องกับการจำแนกด้วยลักษณะทางสัณฐานวิทยา ขณะที่ผลการวิเคราะห์ทาง phylogenetic ในตัวอย่าง ~iT.globulus T.striatus~i และ ~iT.aurantiacus~i ซึ่งไม่สอดคล้องกับการจำแนกทางสัณฐานวิทยา อย่างไรก็ดี เมื่อพิจารณาในกลุ่มเห็ดโคนที่ศึกษาพบว่าเห็ดโคนจากบุรีรัมย์มีความแตกต่างทางพันธุกรรมกับเห็ดโคนจากจังหวัดกาญจนบุรี |
| บรรณานุกรม | : |
ศจิษฐา ประเสริฐกุล . (2547). ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเห็ดโคน ~iTermitomyces sp.~i บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ลำดับพันธุกรรมบริเวณไอทีเอส.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ศจิษฐา ประเสริฐกุล . 2547. "ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเห็ดโคน ~iTermitomyces sp.~i บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ลำดับพันธุกรรมบริเวณไอทีเอส".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ศจิษฐา ประเสริฐกุล . "ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเห็ดโคน ~iTermitomyces sp.~i บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ลำดับพันธุกรรมบริเวณไอทีเอส."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2547. Print. ศจิษฐา ประเสริฐกุล . ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเห็ดโคน ~iTermitomyces sp.~i บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ลำดับพันธุกรรมบริเวณไอทีเอส. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2547.
|
