| ชื่อเรื่อง | : | การคัดแยกและหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนใน~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ CU-A1 |
| นักวิจัย | : | ทิพวรรณ ล้อรัตนไชยยงค์ |
| คำค้น | : | ~iRhizobium~i sp. , TRANSPOSON TN5 , ACENAPHTHYLENE , NUCLEOTIDE SEQUENCES |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2545 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1082545000147 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | ได้คัดแยกและหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับวิถีการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนจากสายพันธุ์กลาย ~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ E11 ที่เกิดจากการสอดแทรกโดยทรานสโปซอนTn~i5~i และมีความบกพร่องในการย่อยสลายอะซีแนพธิลีน จากการติดตามชิ้นทรานสโปซอน Tn~i5~iด้วยเทคนิคเซาท์เธอร์นไฮบริไดเซชันโดยใช้ชิ้นส่วนของทรานสโปซอน Tn~i5~i เป็นดีเอ็นเอติดตามสามารถทำการคัดแยกและโคลนชิ้นดีเอ็นเอที่ให้สัญญาณจากการไฮบริไดซ์ได้ จากการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของดีเอ็นเอข้างเคียงทรานสโปซอนโดยใช้โอลิโกนิวคลีโอไทด์ไพร์เมอร์ที่จำเพาะกับบริเวณปลายของทรานสโปซอน Tn~i5~i เมื่อทำการเปรียบเทียบลำดับกรดอะมิโนที่แปลรหัสมาจากลำดับนิวคลีโอไทด์ขนาด 1,014 bp ที่ได้กับลำดับกรดอะมิโนใน GenBank พบว่าทรานสโปซอนเข้าแทรกยังยีนที่ประมวลรหัสเป็นกรดอะมิโนที่มีความเหมือนกับไฮดราเทส-อัลโดเลสของ~iBurkholderia~i sp. สายพันธุ์ RP007 จากนั้นนำบางส่วนของชิ้นดีเอ็นเอข้างเคียงทรานสโปซอนขนาด 430 bp ที่ได้จากปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสมาสร้างเป็นดีเอ็นเอติดตามเพื่อตรวจหาชิ้นดีเอ็นเอที่ต้องการในสายพันธุ์ดั้งเดิม CU-A1 พบว่าสามารถโคลนชิ้นดีเอ็นเอ ~iBam~iHl-~iHin~idIIIขนาด 4.5 kb ที่ให้สัญญาณกับดีเอ็นเอติดตามเข้ายังพลาสมิด pGEM-3Zf(+/-) และตั้งชื่อพลาสมิดนี้ว่า pWT จากการหาลำดับนิวคลีโอไทด์บนชิ้นดีเอ็นเอขนาด 4.5 kb นี้พบกรอบอ่านรหัสเปิด (ORF) ทั้งหมด 5 กรอบ ซึ่งมีทิศทางการถอดรหัสไปทางเดียวกัน เรียงตามลำดับดังนี้ORF1 เป็นกรอบอ่านรหัสเปิดที่ไม่สมบูรณ์ มีลำดับกรดอะมิโนที่มีความเหมือน 33% กับ putativeFerredoxin reductase ของ ~iRhizobium leguminosarum~i bv. ~iviciae~i ORF2 (~iacnE~i) มีลำดับกรดอะมิโนที่มีความเหมือน 38% กับไฮดราเทส-อัลโดเลสของ ~iBurkholderia~i sp. สายพันธุ์ RP007 ORF3 (~iacnK~i) มีลำดับกรดอะมิโนที่มีความเหมือน 46% กับ 2-คาร์บอนซีเบนซัลดีไฮโดรจีเนส ของ ~iNocardioides~i sp. สายพันธุ์ KP7 ORF4 อยู่ในกรอบอ่านรหัสเปิดที่ต่างจาก ORF1-3 และ 5 มีลำดับกรดอะมิโนที่มีความเหมือน 38% กับโปรตีนที่คล้ายกับแอดดูซิน (adducin like protein) ของ ~iMesorhizobium loti~i ORF5 เป็นกรอบอ่านรหัสเปิดที่ไม่สมบูรณ์ มีลำดับกรดอะมิโนที่มีความเหมือน 43% กับ short-chain dehydrogenase ของ~iPseudomonas aeruginosa~i สายพันธุ์ PA01 การศึกษานี้เป็นรายงานแรกที่ได้กล่าวถึงยีนที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนใน ~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ CU-A1 คือ ยีน~iacnE~i และยีน ~iacnK~i |
| บรรณานุกรม | : |
ทิพวรรณ ล้อรัตนไชยยงค์ . (2545). การคัดแยกและหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนใน~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ CU-A1.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ทิพวรรณ ล้อรัตนไชยยงค์ . 2545. "การคัดแยกและหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนใน~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ CU-A1".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ทิพวรรณ ล้อรัตนไชยยงค์ . "การคัดแยกและหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนใน~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ CU-A1."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2545. Print. ทิพวรรณ ล้อรัตนไชยยงค์ . การคัดแยกและหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายอะซีแนพธิลีนใน~iRhizobium~i sp. สายพันธุ์ CU-A1. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2545.
|
