| ชื่อเรื่อง | : | ?????การทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของแบคทีเรีย?Lactobacilluspentosus และ?Lactobacillus plantarum จากอาหารหมักดองพื้นเมืองโดยวิธี?Random Amplified Polymorphic DNA |
| นักวิจัย | : | ?????ศุภกิจ?สอนประจักษ์ |
| คำค้น | : | GENOMIC DNA , LACTOBACILLUS PENTOSUS , LACTOBACILLUSPLANTARUM , FINGERPRINTING , TRADITIONAL FERMENTED FOOD , RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2539 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1082539000170 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | ?? ในการศึกษานี้ได้ทำการพิสูจน์เอกลักษณ์ของแบคทีเรียแลคติกโดยการทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของเชื้อจำนวนทั้งสิ้น?58strains ซึ่งแยกได้จากอาหารหมักดองพื้นเมืองชนิดต่าง?ๆ?เช่นแหนม?ปลาส้ม?ผักดอง?เป็นต้น?เริ่มจากการสกัดดีเอ็นเอทั้งหมด?(total genomic DNA) ของเชื้อ?โดยผนังเซลชั้นนอกจะถูกย่อยด้วยเอ็นไซม์?lysozyme (100 ug/ml Tris-EDTA-Sodium chloride TES) และ?mutanolysin (1U/ul TES) ก่อนที่จะย่อยเยื้อหุ้มเซลด้วย?proteinase K (1 mg/ml TES)และ? sodium dodecyl sulfate (20% in TES) จากนั้นจึงตกตะกอนแยกเศษผนังเซลโดยใช้?CTAB/NaCl(10% in water) และchloroform/isoamyl alcohol (24:1) จากผลการทดลองพบว่าได้ปริมาณดีเอ็นเอโดยเฉลี่ยประมาณ?3 ug?จากการใช้เซลเชื้อ?2 ml?จนได้ค่า?OD(,600) = 3.5 จากนั้นจึงนำดีเอ็นเอที่ได้มาทดสอบปฏิกิริยาและภาวะที่ใช้ในการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอแบบสุ่มโดยวิธี?Random Amplified polymorphic DNAโดยใช้ดีเอ็นเอของเชื้อสายพันธุ์มาตรฐาน?3?สายพันธุ์ในการทดสอบเพื่อแยกความแตกต่างคือ?type strain ของ?L.pentosusDSM 20314, type strain ของ?L,plantarum DSM 20174 และtype strain ของ P.pentosaceus DSM 20336 โดยทดสอบoligonucleotide primer ที่มีความยาว?10 mers จำนวนทั้งสิ้น?100 primers พบว่า?primer ที่มีลำดับเบส?5'-AGTCAGCCAC-3',5'-CAATCGCCGT-3', 5'GATGACCGCC-3' และ5'-ACTTCGCCAC-3' สามารถที่จะใช้บอกความแตกต่างระหว่างเชื้อ?L.pentosus และ?L.plantarum ได้และพบว่าภาวะที่เหมาะสมในการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอคือการใช้อุณหภูมิในการทำdematuration ที่?94 องศาเซลเซียส?เป็นเวลา?1?นาที,annenaling ที่?35?องศาเซลเซียส?เป็นเวลา?1?นาที?และ?extension ที่?72?องศาเซลเซียส?เป็นเวลา?2?นาที?โดยปฏิกิรยารวม?10?ul ประกอบด้วย?tris-HCI?ความเข้มข้น?10 mM,MgCI(,2) ความเข้มข้น?2 mM,KCI ความเข้มข้น?50 mM,gelatin ความเข้มข้น?0.001%,deoxymucleoside triphosphateความเข้มข้น?100 mM,primer ความเข้มข้น?0.2 uM,?เอ็นไซม์Taq DNA polymerase 1.0 unit และดีเอ็นเอ?3.0 ng จากนั้นจึงนำ?primer ทั้ง?4?มาใช้ในการจัดทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของเชื้อทั้ง?58 strains ?และวิเคราะห์ความแตกต่างของเชื้อแต่ละ?strain โดยค่าความสัมพันธ์?Similarity Index ดังนี้คือSimilarity Index=2n(,xy)/(n(,x)+n(,y))เมื่อ n(,x) และ?n(,y)?คือจำนวน?band ใน?lane X และ?Y ตามลำดับn(,xy)?คือจำนวน?band รวมของ?lane X และ?lane Y ที่มีตำแหน่งตรงกัน????? จากผลการวิเคราะห์ค่า Similarity Index ที่แสดงในรูปของ?dendrogram สามารถจำแนกเชื้อทั้งหมดออกเป็น?4?กลุ่ม?โดยกลุ่มที่?1?ประกอบด้วยเชื้อจำนวน?21 strains ที่มีค่า?Similarity Index กับ?type strain L.pentosus DSM20314 อยู่ระหว่าง?85% ถึง?40% กลุ่มที่?2?ประกอบด้วยเชื้อจำนวน?25 strains ที่มีค่า?Similarity Index กับtpye strain L. plantarum DSM 20174 อยู่ระหว่าง92 % ถึง 23 % กลุ่มที่ 3 ประกอบด้วยเชื้อจำนวน 7 strainsที่มีค่า Similarity Index กับ type strainP.pentosaceus DSM 20336 อยู่ระหว่าง?94% ถึง58%?และมีค่าความสัมพันธ์เพียง?4% กับ?2?กลุ่มแรก?ส่วนกลุ่มที่?4?ประกอบด้วยเชื้อ?4 strain คือ?1145,FN 12-1,P 332-1 และ?P 46-1 ไม่สามารถระบุสายพันธุ์ได้โดยมีค่าSimilarity Index กับ?type strain ของ?L.pentosus DSM20314 และ?type strain ของ?L.plantarum DSM 20174 ที่7%, 7%, 10% และ?13% ตามลำดับ?และ?4% กับ?type strain ของ ?????P.pentosaceus DSM 20336 โดยผลการทดลองที่ได้นี้พบว่ามี ???? ความสอดคล้องกับผลการจัดจำแนกสายพันธุ์เชื้อโดยวิธีทาง ?????ชีวเคมี |
| บรรณานุกรม | : |
?????ศุภกิจ?สอนประจักษ์ . (2539). ?????การทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของแบคทีเรีย?Lactobacilluspentosus และ?Lactobacillus plantarum จากอาหารหมักดองพื้นเมืองโดยวิธี?Random Amplified Polymorphic DNA.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ?????ศุภกิจ?สอนประจักษ์ . 2539. "?????การทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของแบคทีเรีย?Lactobacilluspentosus และ?Lactobacillus plantarum จากอาหารหมักดองพื้นเมืองโดยวิธี?Random Amplified Polymorphic DNA".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ?????ศุภกิจ?สอนประจักษ์ . "?????การทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของแบคทีเรีย?Lactobacilluspentosus และ?Lactobacillus plantarum จากอาหารหมักดองพื้นเมืองโดยวิธี?Random Amplified Polymorphic DNA."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2539. Print. ?????ศุภกิจ?สอนประจักษ์ . ?????การทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอของแบคทีเรีย?Lactobacilluspentosus และ?Lactobacillus plantarum จากอาหารหมักดองพื้นเมืองโดยวิธี?Random Amplified Polymorphic DNA. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2539.
|
