การวิเคราะห์เรสทริกชั่นแฟคเมนท์ดีเอ็นเอ และวิธีการทำ RFLP ได้นำมาใช้ในการตรวจสอบเห็ดลูกผสมจากการรวมเซลล์ โดยได้ศึกษารูปของการเรียงตัวของชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่ถูกตัดด้วยเรสทริกชั่นเอนไซม์ในสายใยของเห็ดโคน (Termitomyces sp.) สายพันธุ์ Tl และ T3 เห็ดฟาง (Volvariellavolvacea), V และเห็ดลูกผสมที่เกิดจากการรวมเซลล์ของสายพันธุ์ทั้งสองชนิดได้แก่ สายพันธุ์ VTl((,7)), VTl((,4y)) และ VT13 พบว่าการตัดดีเอ็นเออย่างสมบูรณ์จะใช้ปริมาณดีเอ็นเอที่สกัดได้ประมาณ 3-5 ไมโครกรัม และเรสทริกชั่นเอนไซม์ Hind III, EcoR I, Pst I หรือ Sma I 6-10 หน่วยและเมื่อนำชิ้นส่วนดีเอ็นเอไปแยกด้วย 1% อะกาโรสเจลอิเลกโทรโฟรีซีสจะได้รูปแบบของการเรียงตัวของชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่ถูกตัดด้วยเรสทริกชั่น-เอนไซม์ Hind III, EcoR I หรือ Pst I ที่แสดงแถบเด่นปรากฏชัดเจนในแต่ละสายพันธุ์ของเห็ดซึ่งแถบดีเอ็นเอของสายพันธุ์ลูกผสมจะมีขนาดเท่ากันกับแถบดีเอ็นเอของสายพันธุ์ต้นแบบ วิเคราะห์ RFLP ด้วยการทำ Southern blot hybridization โดยนำชิ้นส่วนของดีเอ็นเอที่ถูกตัดด้วย Hind III มาไฮบริไดซ์กับโรโบโซมอลดีเอ็นเอ (rDNA) โพรบขนาด 1.9 kb จากเห็ด Schizophyllum commune ได้ผลแสดงแถบดีเอ็นเอที่ไฮบริไดซ์กันขึ้น ในสายพันธุ์ Tl จำนวน 6 แถบ ที่ขนาด 23.1, 9.4, 6.6, 6.0, 4.4 และ 3.5 kb สายพันธุ์ T3 จำนวน 3 แถบที่ขนาด 23.1, 9.4 และ 6.6 kb ส่วนในเห็ดฟางมีจำนวน 2 แถบ ที่ขนาด 23.1 และ 9.4 kb ในสายพันธุ์ลูกผสม VTl (,7)และ VT3 แสดงแถบดีเอ็นเอที่ไฮบริไดซ์ที่ชนาด 9.4 และ 6.6 kb และ สายพันธุ์ VTl (,4Y) จำนวน 2 แถบ ที่ขนาด 23.1 และ 3.5 kb