ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การศึกษายีนฟิแลกกรินในโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัข

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การศึกษายีนฟิแลกกรินในโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัข
นักวิจัย : กรรณาภรณ์ สุริยผล
คำค้น : allele frequencies , canine atopic dermatitis , dog , filaggrin , single nucleotide polymorphism , ความถี่อัลลีล , ฟิแลกกริน , สนิปส์ , สุนัข , โรคผิวหนังภูมิแพ้สุนัข
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2555
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5180171 , http://research.trf.or.th/node/4915
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ฟิแลกกรินเป็นเป็นโปรตีนในกลุ่มคอร์นิไฟด์เอนเวลโลป มีหน้าที่ในการร่วมสร้างและค้ำจุนผิวหนังชั้นหนังกำพร้าซึ่งเป็นปราการป้องกันไม่ให้เชื้อโรคหรือสารก่อภูมิแพ้ต่างๆเข้าสู่ร่างกาย จากรายงานแสดงความสัมพันธ์ของสนิปส์หรือความแตกต่างของนิวคลีโอไทด์ของฟิแลกกรินที่ตำแหน่ง 64,297,022 (อาร์เอส 22588227) บนโครโมโซมที่ 17 ของสุนัขกับโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัขพันธุ์ลาบราดอร์ริทรีฟเวอร์ในสหราชอาณาจักร นำมาสู่การศึกษาในครั้งนี้ซึ่งมีวัตถุประสงค์เพื่อตรวจสอบว่าสนิปส์ ณ ตำแหน่งดังกล่าวมีความเกี่ยวข้องกับการเกิดโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัขสายพันธุ์อื่นหรือไม่ โดยทำการศึกษาความถี่อัลลีลและความถี่จีโนไทป์ของสนิปส์ของฟิแลกกรินที่ตำแหน่ง 64,297,022 บนโครโมโซมที่ 17 ในสุนัขพันธุ์เล็ก 41ตัวประกอบด้วยพันธุ์พุดเดิ้ล 21 ตัว ชิสุ 17 ตัวและปั๊ก 3 ตัว ผลการศึกษาไม่พบความแตกต่างที่ตำแหน่งดังกล่าวระหว่างสุนัขที่เป็นโรคผิวหนังชนิดอะโทปีและกลุ่มควบคุมซึ่งไม่เป็นโรค แต่ในการศึกษาครั้งนี้ได้ค้นพบสนิปส์ใหม่ 13 ตำแหน่งบนยีนฟิแลกกรินของสุนัข และยังได้หาช่วงซ้ำบนยีนช่วงใหม่ซึ่งยังไม่เคยปรากฏในฐานข้อมูลจีโนมสุนัข จากความถี่อัลลีลแสดงให้เห็นว่าสนิปส์ใหม่ 2 ตำแหน่ง ได้แก่ที่ตำแหน่ง 64,297,000 และ 64,297,126 มีแนวโน้มที่จะมีสัมพันธ์กับความไวในการเกิดโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัขอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ โดยสนิปส์ที่ตำแหน่ง 64,297,000 มีค่าพี = 0.041 อัตราเสี่ยงออด = 3.920 ความเสี่ยงสัมพัทธ์ = 3.056 ส่วนสนิปส์ที่ตำแหน่ง 64,297,126 มีค่าพี = 0.043 อัตราเสี่ยงออด = 3.706 ความเสี่ยงสัมพัทธ์ = 2.917 สนิปส์ทั้ง 13 สนิปส์มีความสัมพันธ์กันโดยมีค่าลิงค์เกจดิสอิควิลิเบรียม ≥ 0.89 ในแฮพโพลไทป์บล็อค 1 บล็อคโดยมีความถี่ของแฮพโพลไทป์บล็อค ≥2% การศึกษาครั้งนี้แสดงความเป็นไปได้ของความสัมพันธ์ระหว่างสนิปส์ของฟิแลกกรินกับโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัขพันธุ์เล็ก As a cornified envelope protein, filaggrin (FLG) involved in the formation and support of the skin barrier. FLG single nucleotide polymorphism (SNP) at the position 64,297,022 (rs22588227) on canine chromosome 17 was initially described to be associated with canine atopic dermatitis (CAD) in Labrador Retrievers in UK. The objective of the present study was to examine whether the mentioned FLG SNP was associated with susceptibility to CAD in other breeds. The allele frequencies and genotype frequencies of FLG SNP rs22588227 on chromosome 17 in 41 small breed dogs, 21 Poodles, 17 Shih tzus and 3 Pugs, were studied. The results showed no difference at the above-mentioned position between dogs with atopic dermatitis and controls. However, this study assessed the naturally observed sequence diversity of FLG in the dog, identifying new 13 SNPs within canine FLG and a novel repeated sequence of FLG which did not appear in dog genome databases. Allele frequencies demonstrated that 2 of the novel 13 observed polymorphisms at the locations 64,297,000 (P = 0.041, odds ratio = 3.920, relative risk = 3.056) and 64,297,126 (P = 0.043, odds ratio = 3.706, relative risk = 2.917) were likely to be significantly associated with susceptibility to CAD. The effects of all SNPs was dependent on one another with strong linkage disequilibrium (D’≥0.89) in one haplotype block (frequencies ≥2%). This study demonstrated for the first time the plausible association of SNP of FLG with atopic dermatitis in small breed dogs.

บรรณานุกรม :
กรรณาภรณ์ สุริยผล . (2555). การศึกษายีนฟิแลกกรินในโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัข.
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
กรรณาภรณ์ สุริยผล . 2555. "การศึกษายีนฟิแลกกรินในโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัข".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
กรรณาภรณ์ สุริยผล . "การศึกษายีนฟิแลกกรินในโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัข."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2555. Print.
กรรณาภรณ์ สุริยผล . การศึกษายีนฟิแลกกรินในโรคผิวหนังชนิดอะโทปีในสุนัข. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2555.