การศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างค่าทางเทอร์โมไดนามิกส์และสมบัติทางโครงสร้างของตัวยาในการเกิดสารประกอบเชิงซ้อนไซโคลเด๊กส์ตริน โดยระเบียบวิธีการค านวณเคมีควอนตัม และ เคมีคอมพิวเตอร์ ได้สมการทางคณิตศาสตร์ที่สามารถท านาย อันตรกิริยา และ ความเสถียร ของสารประกอบเชิงซ้อนของไซโคลเด๊กส์ตริน กับ กลุ่มยาที่ท าการศึกษาได้ถูกต้อง ลักษณะโครงสร้างที่ส าคัญ ได้แก่ความพอดีของโมเลกุลที่ไม่มีขั้ว หรือ ส่วนที่ไม่มีขั้ว ของโมเลกุลยา ที่เข้าไปในช่องว่างที่ไม่มีขั้วของไซโคลเด๊กส์ตริน เมื่อโมเลกุลยาเข้าไปในโมเลกุลของไซโคลเด๊กส์ตริน การสัมผัสกับน้า หรือ ตัวท าละลายอื่น มีแนวโน้มที่จะให้เกิดสารประกอบเชิงซ้อนที่ละลายได้ ท าให้ค่าการละลายของยาเพิ่มขึ้น ผลการศึกษาโครงสร้างของเบต้าไซโคลเด๊กส์ตริน ในน้าและสารละลายผสม เมทานอล และ เอทานอล ที่ความเข้มข้น 100%, 50% และ 1% โดยวิธีโมเลคิวลาร์ไดนามิกซิมูเลชัน แสดงให้เห็นถึงความสัมพันธ์ระหว่าง ความสามารถในการละลายของเบต้าไซโคลเด๊กส์ตริน กับ โครงสร้างในการเกิดพันธะไฮโดรเจน ความไม่มีขั้ว และ ขนาดของโมเลกุลตัวท าละลาย ข้อมูลที่ได้เป็นส่วนส าคัญในการค้นหาและพัฒนาโครงสร้างของสารประกอบเชิงซ้อน ที่มีความสามารถในการละลายในระดับที่ต้องการ ในสารละลายสภาวะต่างๆ รวมทั้งท านายการเกิดและความเสถียรของสารประกอบเชิงซ้อน ระหว่าง ยา และ ไซโคลเด๊กส์ตริน ที่สนใจศึกษา ซึ่งจะเป็นประโยชน์อย่างยิ่งในการเสนอแนะ ก่อนท าการสังเคราะห์และวิเคราะห์ผลในห้องปฏิบัติการ ช่วยลดความยุ่งยากและลดต้นทุนให้กับกระบวนการพัฒนาต ารับเภสัชภัณฑ์ น าไปสู่องค์ความรู้ใหม่ในการเพิ่มการละลายของยา โดยการเกิดสารประกอบเชิงซ้อนกับไซโคลเด๊กส์ตริน ซึ่งการศึกษาในแนวทางดังกล่าวจะเป็นวิธีในการออกแบบยาที่มีประสิทธิภาพสูงต่อไป Two novel approaches; binary particle swarm optimization (PSO) and support vector machines (SVMs) are combined for predicting the complex stability constant (K), and the enthalpy (ΔH˚) for the 1:1 inclusion complexation of enantiomeric pairs of chiral guests with β-cyclodextrin (β-CD). The PSO is adopted for influentially descriptors selection in quantitative structure-properties relationship (QSPR) of a data set of 66 chiral guests. A QSPR model is then generated with the selected features by using SVMs. The SVMs are advantageous because of their excellent predictive performance for both training and unseen test sets. Linear, polynomial, and Gaussian radial basis functions are used as kernel in SVMs. Experimental results revealed that the PSO is a useful tool for feature set selection in QSPR of a data set of chiral guests and the SVMs perform very well for finding relationships of the selected major descriptors. The X-ray structures of β-CD were obtained from the Cambridge Crystallographic data base added the hydrogen atoms and was optimized with using Gaussian03 program package. The obtained geometry was taken for further modeling of the inclusion complexes with drug molecules. Docking techniques and quantum calculations were used to study interactions of β-CD with non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs): Nevirapine, Efavirenz, HBY097, and PHI443. The starting geometries of NNRTIs were taken from the Protein Data Bank. Docking was performed using AutoDock 4.2 program. The solutions with the best energy assigned by the AutoDock were selected to further investigated in details by ab-initio (HF/3-21G) method which implement in the Gaussian03 software. The results could explain the β-CD and NNRTI interactions when the crystallographic or NMR structural data is not available. Structural characterizations of β-CD in water, methanol, ethanol and different aqueous solvent mixtures were determined by molecular dymamics (MD) simulations. Methanol and ethanol were used as cosolvents in aqueous solutions, at different concentrations: 100%, 50%, and 1%. The simulations were done at 300 K with constant volume, over a period of about 15 ns using the force field implemented in Amber10 program. The interaction energies and the geometries of the solvated β-CD and the solvent molecules inside the cavity were investigated including the occurrence of hydrogen bonds. The MD simulations lead to an association of 8, 5, and 4 solvent molecules into the β-CD cavity in water, methanol, and ethanol, respectively. In solvent mixtures a slight preference for the inclusion of alcohols can be observed.