โครงการติดตามผลลัพธ์และผลกระทบของโครงการที่ได้รับการสนับสนุนจาก สกว. เกิดจากมติของคณะกรรมการติดตามและประเมินผลการสนับสนุนการวิจัย ใน พ.ศ. 2551 ซึ่งต้องการทราบว่าผลผลิตที่เกิดจากการสนับสนุนของ สกว. ได้ก่อให้เกิดผลต่อเนื่องทั้งในลักษณะผลลัพธ์ (ผลต่อเนื่องจากผลผลิตของโครงการ) และผลกระทบ (ผลต่อเนื่องที่เกิดขึ้นกับประชาคม, สังคม, ประชาชน, ผู้ประกอบการ ฯลฯ) หรือไม่เพียงใด คณะกรรมการจึงได้เลือกโครงการที่ได้รับการสนับสนุนจำนวน 12 โครงการ และแต่งตั้งคณะติดตามขึ้นเพื่อศึกษา วิเคราะห์และจัดทำรายงานเสนอต่อคณะกรรมการ โครงการที่คณะกรรมการคัดเลือกเป็นโครงการที่ได้ดำเนินการเสร็จสิ้นแล้วภายในระยะเวลาหนึ่ง หรือชุดโครงการต่อเนื่องซึ่งมีผลงานเกิดขึ้น และคาดว่าจะมีผลลัพธ์และผลกระทบบ้างแล้ว ได้แก่ 1. โครงการปฏิรูปสื่อ 2. โครงการการพัฒนาระบบบริหารราชการของไทยในต่างประเทศ 3. ชุดโครงการพัฒนาหอยเป๋าฮื้อพันธุ์ไทยเชิงพาณิชย์ 4. โครงการจัดการธาตุอาหารเฉพาะพื้นที่เพื่อการผลิตพืชอย่างยั่งยืน (ข้าวและอ้อย) 5. ชุดโครงการเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อม 6. โครงการติดตามสภาวการณ์เด็กและเยาวชน 7. ชุดโครงการจัดการโลจิสติกส์และโซ่อุปทาน 8. โครงการฝ่ายวิชาการกับการสร้างนักวิจัยรุ่นใหม่ทั่วประเทศ 9. โครงการค้างคาวและโรคพิษสุนัขบ้า 10. โครงการปริญญาเอกกาญจนาภิเษก 11. โครงการวิจัยเพื่อท้องถิ่น 12. โครงการ IRPUS เนื่องจาก สกว. ยังมิได้จัดวางระบบติดตามผลลัพธ์ และผลกระทบของโครงการที่ให้การสนับสนุนอย่างเป็นระบบมาก่อน คณะผู้ติดตามจึงต้องใช้วิธีการต่าง ๆ เช่น การสัมภาษณ์ การระดมสมองผู้เกี่ยวข้อง การวิเคราะห์เอกสาร การออกแบบสอบถาม การสังเกตการณ์ภาคสนาม ฯลฯ เพื่อให้ได้ข้อมูลเพียงพอสำหรับการสรุปผล ซึ่งคณะผู้ติดตามสามารถรวบรวมข้อมูลและรายงานผลสรุปได้เป็นที่น่าพอใจ