การนำเทคนิค Polymerase Chain Reaction และ nucleotide sequencing มาใช้ศึกษาและวิเคราะห์ด้านระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อยไทป์โอ และไทป์เอ ที่ระบาดในประเทศไทย เวียดนาม และลาว ระหว่างปี พ.ศ.2553-2555 จากตัวอย่างไวรัสไทป์โอ 22 ตัวอย่าง และไทป์เอ 62 ตัวอย่าง ซึ่งได้ผ่านการตรวจวินิจฉัยด้วย ELISA typing นำมาเพิ่มปริมาณ cDNA ด้วยเทคนิค PCR โดยใช้ specific primer 1C-609/NK61 และ 1C-612/NK61 สำหรับไวรัสไทป์โอ และไทป์เอ ตามลำดับ นำ PCR product ที่ได้ไปตรวจวิเคราะห์ด้านระบาดวิทยาระดับโมเลกุล โดยวิธี nucleotide sequencing เพื่อดูการเรียงลำดับเบสบนสาย cDNA ในส่วนของ VP1 gene จนได้ complete gene ที่มีความยาว 639 และ 636 nucleotide สำหรับ VP1 ไทป์โอ และไทป์เอ ตามลำดับ ทำการวิเคราะห์ผลโดยแสดงในรูปของ phylogenetic tree พบว่าเชื้อไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อยไทป์โอที่ระบาดในประเทศไทยในปี พ.ศ.2553 ยังจัดอยู่ในกลุ่มการระบาดเดิม คือกลุ่ม SEA topotype ทุกตัวอย่าง และในปี พ.ศ.2554 พบว่าไทป์โอที่เกิดการระบาดในประเทศไทย แยกออกได้เป็น 2 กลุ่ม คือกลุ่ม SEA topotype และ ME-SA topotype ส่วนไวรัสไทป์โอที่ระบาดในประเทศเวียดนาม และลาว ในปี พ.ศ.2553 ยังคงจัดอยู่ในกลุ่ม SEA topotype และไวรัสไทป์เอ ที่เกิดการระบาดในประเทศไทย และเวียดนาม ระหว่างปี พ.ศ.2553-2555 จัดอยู่ในกลุ่ม ASIA topotype ทั้งหมด จากการศึกษาครั้งนี้นับว่าเป็นประโยชน์สำหรับการสืบกลับถึงไวรัสต้นกำเนิดที่ทำให้เกิดโรคระบาดในพื้นที่ และใช้สนับสนุนการคัดเลือก seed vaccine virus สำหรับผลิตวัคซีนให้มีประสิทธิภาพต่อไป