มันสำปะหลังเป็นพืชที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจของประเทศไทย แป้งที่สะสมอยู่ในรากถูกนำมาใช้ในทางอุตสาหกรรมหลายประเภท ในงานวิจัยนี้ใช้เทคนิค cDNA-AFLP เพื่อค้นหายีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างรากสะสมอาหารของมันสำปะหลัง cDNA จากมันสำปะหลังที่ปลูกในช่วงหน้าแล้งและหน้าฝน ถูกนำมาเปรียบเทียบรูปแบบการแสดงออกของยีนในใบ รากฝอย และ รากสะสมอาหาร (cortex และ parenchyma) โดยใช้ไพรเมอร์ 134 คู่ จากผลการทดลอง พบยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (TDFs) ซึ่งถูกนำไปหาลำดับเบสและ สามารถจัดกลุ่มยีนตามหน้าที่ของโปรตีนได้ทั้งหมด 11 กลุ่มรวม 100 TDFs พบว่ากลุ่มยีนที่พบมากที่สุด 3 กลุ่มแรกคือ กลุ่มยีน (TDFs) ที่ไม่มีความคล้ายคลึงกับโปรตีนในฐานข้อมูล (27%) กลุ่มยีนที่เกี่ยวข้องกับ cellular metabolism และ biosynthesis (15%) และ กลุ่มยีนที่ยังไม่ทราบหน้าที่ (15%) ตามลำดับ การแสดงออกของ 33 TDFs (18 TDFDs และ 15 TDFWs) ถูกนำมาวิเคราะห์อีกครั้งด้วยวิธี semi-quantitative RT-PCR โดยใช้ตัวอย่างที่ปลูกในช่วงหน้าฝนและแล้ง จากการศึกษาพบว่า 10 TDFs มีการแสดงออกสูงในรากสะสมอาหาร และ 2 TDFs มีการแสดงออกทั้งในรากสะสมอาหารและในใบ ประกอบด้วย 1 TDF (TDFD-26) ที่ไม่มีความคล้ายคลึงกับโปรตีนในฐานข้อมูล 4 TDFs (TDFW-49, 72, 116 and TDFD-163) เป็นยีนที่ยังไม่ทราบหน้าที่ และ 7 TDFs เป็นโปรตีนที่ทราบหน้าที่แล้ว ได้แก่ TDFD-78, TDFD-82, TDFD-83, TDFD-102, TDFD-106, TDFD-142 และ TDFW-31 จากการศึกษา TDFD-82; sulfite reductase มีการแสดงออกเพิ่มขึ้นตามการพัฒนาของรากสะสมซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับการดูดซึม ซัลเฟอร์เพื่อใช้ในกระบวนการสังเคราะห์กรดอะมิโน และในการลดความเป็นพิษของ cyanide TDFD-142; AP2/EREBP transcription factor ERF-2 แสดงออกลดลงในช่วงที่ปริมาณน้ำฝนน้อยดังนั้นอาจเกี่ยวข้องกับการตอบสนองต่อ สภาวะแล้ง TDFD-83; calcium-dependent protein kinase และ 102; mitotic checkpoint protein มีการแสดงออกมากใน cortex โดย TDFD-83 มีบทบาทในการสื่อสัญญาณระหว่างเซลล์ซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับการสร้างราก การเพิ่มขนาดและการยืดตัวของเซลล์และ TDFD-102 เกี่ยวข้องกับการควบคุมการแบ่งเซลล์ที่ระดับ DNA ในช่วงการพัฒนาของเนื้อเยื่อลำเลียง TDFD-106; ent-kaurene synthase อาจเกี่ยวข้องกับการพัฒนาของ proplastid และการสะสมแป้ง TDFD-78 เกี่ยวข้องกับการควบคุมการขนส่งสารอาหารจากใบสู่รากสะสมอาหาร การแสดงออกของ TDFW-31 (mitocondrial citrate synthase) มีความสัมพันธ์กับปริมาณน้ำฝน ซึ่งอาจมีผลเพิ่มการดูดซึม phosphate เข้าสู่รากเพื่อใช้ในการสร้างและพัฒนารากสะสม ยีนที่ได้จากการทดลองนี้ทำให้เข้าใจกระบวนการสร้างแป้งและการพัฒนาของราก สะสมอาหารมากขึ้นและยีนเหล่านี้จะถูกนำไปศึกษาเพิ่มเติมและเปรียบเทียบกับ ฐานข้อมูลทางด้าน transcriptomics และ proteomics ที่สร้างขึ้นโดยเครือข่ายการวิจัยเทคโนโลยีชีวโมเลกุลมันสำปะหลัง