Analisis kualitas air dan hubungannya dengan keanekaragaman vegetasi akuatik telah diteliti pada bulan Agustus 2008 – Maret 2009 pada 4 lokasi penelitian di Perairan Danau Toba, Balige. Lokasi penelitian ditentukan dengan menggunakan metode Purposive Random Sampling berdasarkan aktivitas yang bervariasi pada masing-masing lokasi penelitian, dan setiap stasiun dibagi menjadi 3 titik dengan masing-masing kedalaman yang berbeda yaitu 0m, 5m, 10m, 15m. Analisis dilakukan dengan komputerisasi Program SPSS versi 15. Parameter yang diamati adalah faktor fisik-kimia dan biologis perairan seperti suhu air, penetrasi cahaya, intensitas cahaya, DO, Kejenuhan oksigen, BOD5, COD, pH air, Nitrat, Fosfat, Fecal coliform dan substrat organik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai rata-rata faktor suhu air pada lokasi pengamatan berkisar antara 24,37-25 0C, DO antara 6,82-7,1 mg/l, BOD antara 0.67-1,42 mg/l, adalah tidak berbeda nyata antar lokasi pengamatan. Sedangkan NO3 antara 0,25-0,47mg/l, PO4 antara 0,01-0,02mg/l, kejenuhan oksigen antara 84,15-91,48%, pH antara 7,12-7,4 adalah berbeda nyata antar lokasi pengamatan. Untuk nilai Fecal coliform adalah berkisar antara 3-1100 MPN, Substrat 1,03-8,68%, Intensitas cahaya 915-505Cd dan Penetrasi cahaya masing-masing adalah 10m. Berdasarkan kriteria dari nilai kejenuhan oksigen, perairan Danau Toba termasuk perairan oligotrofik. Mengacu pada Peraturan Pemerintah Nomor 82 Tahun 2001 tentang Pengelolaan Kualitas Air dan Pengendalian Pencemaran Air, maka dapat disimpulkan bahwa air Danau Toba pada setiap lokasi pengamatan adalah Kriteria Mutu Air Kelas 1. Hasil penelitian di perairan Danau Toba ditemukan 9 jenis vegetasi akuatik yaitu: Eichhornia crassipes, Hydrilla verticillata, Ipomoea aquatica, Potamogeton crispus, Salvinia molesta, Leersia hexandra, Myriophyllum dicoccum, Najas minor dan Equisetum hyemale. Analisis persentase dari kerapatan dan frekwensi kehadiran diperoleh hasil bahwa spesies yang dominan di perairan Danau Toba adalah Hydrilla verticillata dengan Indeks Nilai Penting berkisar 45,81 sampai 97,35. Indeks keanekaragaman vegetasi akuatik diperoleh nilai berkisar 0,81 – 1,56, Indeks keseragaman 0,50 – 0,87, Indeks similaritas sebesar 80%. Hasil uji korelasi Pearson menunjukkan bahwa pH, dan COD berpengaruh nyata sedangkan Kejenuhan Oksigen, NO3 berpengaruh sangat nyata terhadap keanekaragaman vegetasi akuatik yang terdapat di perairan Danau Toba.

10E00168