| ชื่อเรื่อง | : | Performance analysis & improvement of SNPHAP on Multi-core CPUs |
| นักวิจัย | : | Ranokphanuwat, Ratthaslip , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima |
| คำค้น | : | Algorithms , Application Programming Interfaces (API) , Cache Memory , Clock Frequency , Computational Complexity , Computational Problem , Haplotype Inference , Hyper-Threading , Inference Engines , Information technology , Memory Technology , Microprocessor Chips , Multi-Core Cpus , Performance Analysis , Program Processors , Run Time Complexity , สาขาเทคโนโลยีสารสนเทศและนิเทศศาสตร์ |
| หน่วยงาน | : | สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2556 |
| อ้างอิง | : | http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/25291 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | In this paper, we attempt to analyse this highly computational problem by parallelizing a haplotype inference algorithm, called SNPHAP. The analysis is based on both the orignal (sequential) algorithm and its corresponding run time complexity in Big-O notations. Then, we improve its performance using OpenMP 3.0 and test on a 4-core Intel Core i7-2600 (Hyper-Threading), an 8-core Intel XeonE5405, an 8-core Intel Xeon E5520 (Hyper-Threading) and a 32-core AMD Opteron 8356 Linux machines. The achievements in terms of maximum speedups are 260%, 316%, 410% and 488%, respectively. The factors that affect the speedup of SNPHAP are the specific parallelized code fraction, the suitable OpenMP constructs, the number of physical cores, the sizes of cache memories within/among CPU cores, the clock frequency and finally the memory technology. |
| บรรณานุกรม | : |
Ranokphanuwat, Ratthaslip , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . (2556). Performance analysis & improvement of SNPHAP on Multi-core CPUs.
ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. Ranokphanuwat, Ratthaslip , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . 2556. "Performance analysis & improvement of SNPHAP on Multi-core CPUs".
ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. Ranokphanuwat, Ratthaslip , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . "Performance analysis & improvement of SNPHAP on Multi-core CPUs."
ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2556. Print. Ranokphanuwat, Ratthaslip , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . Performance analysis & improvement of SNPHAP on Multi-core CPUs. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2556.
|
ridm@nrct.go.th ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย รายการโปรดที่คุณเลือกไว้
