ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP
นักวิจัย : Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima
คำค้น : Application Programming Interfaces (API) , Complexity Functions , Computer Operating Systems , Computer Science , Haplotype Inference , Linux Machines , Multi-threading , Multitasking , Openmp , Optimization , Radix 2 , Run Time Complexity , Snphap , สาขาเกษตรศาสตร์และชีววิทยา
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2556
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/25252
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

In this paper, the run time complexity of SNPHAP, which is a haplotype inference tool, is extensively examined. The analysis is based on our previous work in terms of profiling and run-time complexity function. To reduce the run time complexity and enhance its performance, a Radix-2 computation and OpenMP multithreading are applied. The optimized results are compared with both original and compiler optimized versions on an AMD A6-3650 Linux machine. Due to the Radix-2 technique, the complexity is drastically reduced. In addition, the theoretical Speedup is consistent with the experimental one. Furthermore, up to 1,303% Speedup is achievable as a result of OpenMP multithreading.

บรรณานุกรม :
Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . (2556). Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . 2556. "Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . "Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2556. Print.
Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2556.