| ชื่อเรื่อง | : | Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP |
| นักวิจัย | : | Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima |
| คำค้น | : | Application Programming Interfaces (API) , Complexity Functions , Computer Operating Systems , Computer Science , Haplotype Inference , Linux Machines , Multi-threading , Multitasking , Openmp , Optimization , Radix 2 , Run Time Complexity , Snphap , สาขาเกษตรศาสตร์และชีววิทยา |
| หน่วยงาน | : | สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2556 |
| อ้างอิง | : | http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/25252 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | In this paper, the run time complexity of SNPHAP, which is a haplotype inference tool, is extensively examined. The analysis is based on our previous work in terms of profiling and run-time complexity function. To reduce the run time complexity and enhance its performance, a Radix-2 computation and OpenMP multithreading are applied. The optimized results are compared with both original and compiler optimized versions on an AMD A6-3650 Linux machine. Due to the Radix-2 technique, the complexity is drastically reduced. In addition, the theoretical Speedup is consistent with the experimental one. Furthermore, up to 1,303% Speedup is achievable as a result of OpenMP multithreading. |
| บรรณานุกรม | : |
Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . (2556). Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP.
ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . 2556. "Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP".
ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . "Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP."
ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2556. Print. Ranokphanuwat, Ratthaslip , Rattanatranurak, Apisit , Kittitornkun, Surin , Sissades Tongsima . Analysing and Optimizing SNPHAP using Radix-2 Computation and OpenMP. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2556.
|
