ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Identification and characterization of a cellulaseencoding gene from the buffalo rumen metagenomic library

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Identification and characterization of a cellulaseencoding gene from the buffalo rumen metagenomic library
นักวิจัย : Nhung Hong Nguyen , Lalita Maruset , Tanaporn Uengwetwanit , Wuttichai Mhuantong , Piyanun Harnpicharnchai , Verawat Champreda , Sutipa Tanapongpipat , Kanya Jirajaroenrat , Sudip K. Rakshit , Lily Eurwilaichitr , Somchai Pongpattanakitshote , วุฒิชัย เหมือนทอง , ปิยนันท์ หาญพิชาญชัย , วีระวัฒน์ แช่มปรีดา , สุทิพา ธนพงศ์พิพัฒน์ , กัญญา จิระเจริญรัตน์
คำค้น : Biological sciences , Bullafo , Cellulaseencoding gene , Microbiology , Microorganisms , Rumens , ควาย , จุลินทรีย์ , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ , สาขาเกษตรศาสตร์และชีววิทยา
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2555
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/23620
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Microorganisms residing in the rumens of cattle represent a rich source of lignocellulose-degrading enzymes, since their diet consists of plant-based materials that are high in cellulose and hemicellulose. In this study, a metagenomic library was constructed from buffalo rumen contents using pCC1FOS fosmid vector. Ninety-three clones from the pooled library of approximately 10,000 clones showed degrading activity against AZCL-HE-Cellulose, whereas four other clones showed activity against AZCL-Xylan. Contig analysis of pyrosequencing data derived from the selected strongly positive clones revealed 15 ORFs that were closely related to lignocellulose-degrading enzymes belonging to several glycosyl hydrolase families. Glycosyl hydrolase family 5 (GHF5) was the most abundant glycosyl hydrolase found, and a majority of the GHF5s in our metagenomes were closely related to several ruminal bacteria, especially ones from other buffalo rumen metagenomes. Characterization of BT-01, a selected clone with highest cellulase activity from the primary plate screening assay, revealed a cellulase encoding gene with optimal working conditions at pH 5.5 at 50 °C. Along with its stability over acidic pH, the capability efficiently to hydrolyze cellulose in feed for broiler chickens, as exhibited in an in vitro digestibility test, suggests that BT-01 has potential application as a feed supplement.

บรรณานุกรม :