ปัญหาที่สำคัญที่เผชิญหน้าอุตสาหกรรมการเลี้ยงกุ้งทะเลในประเทศไทยใน ปัจจุบัน คือ การรักษาสมดุลย์ระหว่างผลผลิตกุ้งทะเลกับคุณภาพน้ำ เพื่อที่จะให้ได้ผลตอบแทนที่เหมาะสม และในขณะเดียวกันก็รักษาสภาพแหล่งน้ำให้อยู่ในสภาพที่ดี การเลี้ยงกุ้งของผู้เลี้ยงในระยะเวลาที่ผ่านมากมักปล่อยกุ้งในอัตราปล่อยต่อ พื้นที่สูงและให้อาหาร ในปริมาณมาก โดยใช้เครื่องให้อากาศเป็นตัวป้องกันการขาดออกซิเจนในน้ำ อย่างไรก็ตามสารพิษที่เกิดจากการเน่าสลายของสารอินทรีย์ เช่น แอมโมเนีย ไนไตรท์ ไฮโดรเจนซัลไฟด์ และคาร์บอนไดออกไซด์ จะสะสมอยู่ในน้ำในบ่อ สารอินทรีย์ที่เหลือตกค้างที่พื้นบ่อก็จะสลายตัวให้สารพิษเหล่านี้ออกมาทำ ให้เกิดปัญหาอยู่เสมอ เป้าหมายรวมของโครงการวิจัยนี้ก็เพื่อพัฒนาวิธีการที่มีประสิทธิภาพในการ ป้องกันและแก้ไขปัญหาเกี่ยวกับสารพิษที่เกิดจากการเน่าสลายของสารอินทรีย์ใน บ่อเลี้ยงกุ้งทะเล โดยมีวัตถุประสงค์ของโครงการดังนี้ : (1) เพื่อหาอัตราการให้อาหารสูงสุดที่เป็นไปได้ โดยไม่มีผลกระทบต่อการเลี้ยงกุ้งในสภาพของแหล่งน้ำแต่ละแหล่งที่มีสภาพของ น้ำในแหล่งน้ำต่าง ๆ กัน (2) ประเมินวิธีการทางเคมีและชีวในการกำจัดสารพิษเหล่านี้ (3) พัฒนาวิธีการหมุนเวียนน้ำเพื่อให้พื้นบ่ออยู่ในสภาพที่ไม่ขาดออกซิเจน ซึ่งจะทำให้การสร้างสารพิษในสภาพรีดิวซ์ลดลง (4) หาวิธีการที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดในการกำจัดตะกอนเลนที่มีสารอินทรีย์ สะสมออกจากบ่อ เพื่อป้องกันการเกิดสารพิษ