แป้งที่เป็นองค์ประกอบของเมล็ดข้าวมี 2 ชนิดคือแป้งอมิโลสและแป้งอมิโลเพ็กติน ยีนแวคซีจะทำหน้าที่ควบคุมการสร้างแป้งอมิโลสโดยผ่านการสร้างเอ็นไซม์ granule-bound strach synthase (GBSS) เข้าร่วมมีบทบาทในการสร้างแป้งชนิดอโลสในเอ็นโดสเปิร์มของเมล็ดข้าว ปริมาณแป้งอมิโลสเป็นสิ่งบ่งชี้ถึงคุณภาพการหุงต้มที่ผู้บริโภคยอมรับ ยีนแวคซีข้าวกลุ่มอมิโลสต่ำพบว่าเกิดการผันแปร (mutation) ของเบส 1 ตำแหน่งที่บริเวณ 5? splice site จาก G เป็น T ทำให้พันธุ์ข้าวดังกล่าวที่มีการแสดงออกของยีนนี้ลดลงเมื่อเทียบกับพันธุ์ ข้าวที่มีเบสเป็น G ที่บริเวณนี้ ผลที่ตามมาคือพันธุ์ข้าวเจ้าที่มีการแปรผันของเบสตำแหน่งนี้มีปริมาณอมิโลส จัดอยู่ในกลุ่มอมิโลสต่ำ ข้อมูลของการแสดงออกของยีนแวคซีในข้าวไทย ในระดับหลังการถอดรหัสยังไม่มีการศึกษา ซึ่งความเข้าใจการแสดงออกของยีนนี้นับว่าเป็นความท้าทายของนักชีววิทยาที่จะ อธิบายบทบาทของยีนในกระบวนการสร้างแป้งอมิโลสอันเป็นลักษณะที่สำคัญของ คุณภาพการหุงต้มของข้าวโดยเฉพาะอย่างยิ่งข้าวพันธุ์ขาวดอกมะลิ 105 ข้าวพันธุ์นี้มีความสำคัญต่อเศรษฐกิจและสังคมของไทยและเป็นข้าวที่มีชื่อ เสียงในด้านคุณภาพในกลุ่มข้าวอมิโลสต่ำของไทย องค์ความรู้ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์แป้งอมิโลส นับว่ามีความจำเป็นเพื่อการอธิบายกลไกการแสดงออกของยีน ดังนั้นโครงการวิจัยนี้จึงมีแนวคิดที่จะศึกษาการแสดงออกของยีนแวคซี ในระดับหลังจากการถอดรหัสของพันธุ์ข้าวเจ้ากลุ่มอมิโลสต่ำ และอมิโลสสูงของไทยโดยศึกษาการแสดงออกของยีนในระดับ mRNA โดยศึกษา pre-mRNA splicing ของยีนแวคซี