ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการเกิดเมธิลเลชั่นในจีโนมและความชราภาพของเซลล์  

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการเกิดเมธิลเลชั่นในจีโนมและความชราภาพของเซลล์  
นักวิจัย : พรรัศมิ์ จินตฤทธิ์
คำค้น : aging , genome-wide methylation , global hypomethylation , interspersed repetitive sequences , การลดลงของการเติมหมู่เมททิล , การเติมหมู่เมททิลในจีโนม , ความชราภาพ , ชนิดตำแหน่งดีเอนเอที่มีลำดับเบสซ้ำกัน
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2553
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5180072 , http://research.trf.or.th/node/3002
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ตำแหน่งดีเอนเอที่มีลำดับเบสซ้ำกัน (IRS) จะอยู่กระจายเป็นส่วนใหญ่ตามขนาดของจีโนมและอาจส่งผลต่อการทำหน้าที่ของเซล ซึ่งสามารถแบ่งได้ตามขนาดและหน้าที่เชิงโครงสร้างได้เป็น บริเวณที่มีลำดับเบสซ้ำขนาดสั้น (short interspersed elements), บริเวณที่มีลำดับเบสซ้ำขนาดยาว (long interspersed elements), บริเวณที่มีลำดับเบสซ้ำที่สามารถเคลื่อนไปมาจากตำแหน่งหนึ่งไปอีกตำแหน่งหนึ่งได้โดยตรง (DNA transposon) และบริเวณที่มีลำดับเบสซ้ำส่วนปลายที่สามารถเคลื่อนไปมาจากตำแหน่งหนึ่งไปอีกตำแหน่งโดยใช้ RNA (LTR-retrotransposon) มีหลายชนิดของตำแหน่งเหล่านี้อาจผลิต RNA และควบคุมยีนโดยอาศัยกลไกที่หลากหลาย การเติมหมู่เมททิลบนลำดับดีเอนเอส่วนใหญ่แล้วเกิดในบริเวณ IRS และเชื่อว่าทำให้กดการทำงานของ IRS การลดลงของการเติมหมู่เมททิลทั่วทั้งหมด (Global hypomethylation) หรือการบกพร่องของการเติมหมู่เมททิลในจีโนม (Loss of genome-wide methylation) เป็นสภาวะเหนือพันธุกรรมที่พบบ่อยทั้งในเซลล์ที่ชราภาพและเซลมะเร็ง การลดลงของการเติมหมู่เมททิลบนลำดับดีเอนเอที่ตำแหน่งของไลน์-1 (LINE-1) มีการศึกษาอย่างกว้างขวางในเซลมะเร็งเกือบทุกชนิด ดังนั้นการศึกษานี้คณะผู้วิจัยจึงศึกษาการเติมหมู่เมททิลบริเวณตำแหน่งไลน์-1 (LINE-1), อะลู (Alu) และโปรไวรัส K (Human endogenous retrovirus, HERV-K) ในเซลเม็ดเลือดขาวชนิด mononuclear cell ของอาสาสมัครปกติจำนวน 177 ราย ช่วงอายุระหว่าง 20-88 ปี พบว่าอายุมีความสัมพันธ์ในเชิงลบกับระดับเมธิลเลชั่นที่ตำแหน่งอะลู และโปรไวรัส K อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (rAlu = -0.452, P<10-3, rHERV-K = -0.326, P<10-3) แต่ไม่พบความสัมพันธ์ในตำแหน่งไลน์-1 (rLINE-1=0.145, P=0.055) การบกพร่องของการเติมหมู่เมททิลที่ตำแหน่งอะลูพบในช่วงอายุ 34-68 ปี และที่ตำแหน่งโปรไวรัส K พบในช่วงอายุ 40-63 ปี และ 64-83 ปี และเป็นที่น่าสนใจอย่างยิ่งพบว่ามีความสัมพันธ์ในเชิงบวกของการเติมหมู่เมททิลของตำแหน่งอะลูและไลน์-1 ในช่วงอายุมากกว่าหรือเท่ากับ 49 ปี (r=0.49, P<10-3) จากผลการศึกษานี้แสดงว่าการบกพร่องตามอายุของการเติมหมู่เมททิลบนลำดับดีเอนเอของชนิดตำแหน่งที่มีลำดับเบสซ้ำกันนั้นต่างกันและพบในบางตำแหน่งและบางช่วงจำเพาะของอายุเท่านั้น การบกพร่องตามอายุของการเติมหมู่เมททิลที่ตำแหน่งอะลูและตำแหน่งของโปรไวรัส K แตกต่างกัน และอาจมีกลไก 2-3 ชนิด ที่เกี่ยวข้องกับการเติมหมู่เมททิลทั่วทั้งหมดในจีโนม ซึ่งกลไกเหล่านี้ไม่ใช่ทั้งหมดที่ขึ้นกับอายุ การศึกษาครั้งนี้อาจนำไปสู่ความเข้าใจที่ดีขึ้นทั้งสาเหตุทางชีววิทยาระดับเซลล์และผลกระทบของการลดลงการเติมหมู่เมททิลทั่วทั้งหมดในจีโนม ตลอดจนบทบาทของชนิดตำแหน่งดีเอนเอที่มีลำดับเบสซ้ำกันในขั้นตอนที่เกี่ยวข้องกับความชราภาพ Interspersed repetitive sequences (IRSs) are a major contributor to genome size and may contribute to cellular functions. IRSs are subdivided according to size and functionally related structures into short interspersed elements (SINEs), long interspersed elements (LINEs), DNA transposons and LTR-retrotransposons. Many IRSs may produce RNA and regulate genes by a variety of mechanisms. The majority of DNA methylation occurs in IRSs and is believed to suppress IRS activities. Global hypomethylation, or the loss of genome-wide methylation, is a common epigenetic event not only in senescent cells but also in cancer cells. Loss of LINE-1 methylation has been characterized in many cancers. Here, we evaluated the methylation levels of LINE-1, Alu and human endogenous retrovirus (HERV-K) in 177 samples obtained from volunteers between 20 and 88 years of age. Age was negatively associated with methylation levels of Alu (r=-0.452, p10-3) and HERV-K (r=-0.326, p10-3) but not LINE-1 (r=0.145, p=0.055). Loss of methylation of Alu occurred during ages 34-68 yr, and loss of methylation of HERV-K occurred during ages 40-63 and again during ages 64-83 yr. Interestingly, methylation of Alu and LINE-1 are directly associated, particularly at ages 49 yr and older (r=0.49, p10-3). Therefore, only some types of IRSs lose methylation at certain ages. Moreover, Alu and HERV-K become hypomethylated differently. Finally, there may be several mechanisms of global methylation. However, not all of these mechanisms are age-dependent. This finding may lead to a better understanding of not only the biological causes and consequences of genome-wide hypomethylation but also the role of IRSs in the aging process

บรรณานุกรม :
พรรัศมิ์ จินตฤทธิ์ . (2553). ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการเกิดเมธิลเลชั่นในจีโนมและความชราภาพของเซลล์  .
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
พรรัศมิ์ จินตฤทธิ์ . 2553. "ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการเกิดเมธิลเลชั่นในจีโนมและความชราภาพของเซลล์  ".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
พรรัศมิ์ จินตฤทธิ์ . "ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการเกิดเมธิลเลชั่นในจีโนมและความชราภาพของเซลล์  ."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2553. Print.
พรรัศมิ์ จินตฤทธิ์ . ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการเกิดเมธิลเลชั่นในจีโนมและความชราภาพของเซลล์  . กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2553.