ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

GPU accelerated molecular docking with parallel genetic algorithm

หน่วยงาน Nanyang Technological University, Singapore

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : GPU accelerated molecular docking with parallel genetic algorithm
นักวิจัย : Ouyang, Xuchang , Kwoh, Chee Keong
คำค้น : DRNTU::Engineering::Computer science and engineering.
หน่วยงาน : Nanyang Technological University, Singapore
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2555
อ้างอิง : Ouyang, X., & Kwoh, C. K. (2012). GPU Accelerated Molecular Docking with Parallel Genetic Algorithm. 2012 IEEE 18th International Conference on Parallel and Distributed Systems. , http://hdl.handle.net/10220/12426 , http://dx.doi.org/10.1109/ICPADS.2012.99
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Molecular docking is a widely used tool in Computer-aided Drug Design and Discovery. Due to the complexity of simulating the chemical events when two molecules interact, highly accelerated molecular docking programs are of great interest and importance for practical use. In this paper, we present a GPU accelerated docking program implemented with CUDA. The hardware-enabled texture interpolation is employed for fast energy evaluation. Two types of parallel genetic algorithms are mapped to the CUDA computing architecture and used for the search of optimal docking result. Comparing to the CPU implementation, the GPU accelerated docking program achieved significant speedup while producing comparable results to the CPU version. The source code is made public at http://code.google.com/p/cudock/.

บรรณานุกรม :
Ouyang, Xuchang , Kwoh, Chee Keong . (2555). GPU accelerated molecular docking with parallel genetic algorithm.
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Ouyang, Xuchang , Kwoh, Chee Keong . 2555. "GPU accelerated molecular docking with parallel genetic algorithm".
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Ouyang, Xuchang , Kwoh, Chee Keong . "GPU accelerated molecular docking with parallel genetic algorithm."
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore, 2555. Print.
Ouyang, Xuchang , Kwoh, Chee Keong . GPU accelerated molecular docking with parallel genetic algorithm. กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore; 2555.