ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่ การหาระยะทางทางกายภาพ และการทำchromosome walk เพื่อแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ในมะเขือเทศ

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่ การหาระยะทางทางกายภาพ และการทำchromosome walk เพื่อแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ในมะเขือเทศ
นักวิจัย : ราตรี บุญเรืองรอด
คำค้น : -
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2546
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1162546000648
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

โรคใบไหม้ในมะเขือเทศเกิดจากเชื้อ ~iPhytophthora infestans~i เป็นโรคหนึ่งที่สร้างความเสียหายให้กับมะเขือเทศ (~iLycopersicon esculentum~i) ที่ปลูกในเขตร้อนและกึ่งร้อน ได้มีการนำมะเขือเทศพันธุ์ L3708 (~iL. pimpinellifolium~i) มาทดสอบความต้านทาน พบว่ามีลักษณะต้านทานเชื้อโรคนี้ โดยยีนต้านทานโรคใบไหม้ (~iPh-3~i)จากมะเขือเทศพันธุ์ L3708 มีตำแหน่งอยู่บนโครโมโซม 9 ในการแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ (~iPh-3~i) โดยอาศัยแผนที่โครโมโซม จำเป็นต้องใช้จีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่เพื่อใช้ในการทำ chromosome walk ดังนั้นจึงสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่จากมะเขือเทศพันธุ์ L3708 จำนวน 3 ชุด ได้แก่ ไลบรารี STG และ MTGซึ่งสร้างโดยใช้เวคเตอร์ BIBAC2 และเอนไซม์ตัดจำเพาะ ~iBam~iHI และ ไลบรารี CHSสร้างโดยใช้เวคเตอร์ pCLD04541 และเอนไซม์ตัดจำเพาะ ~iHin~iIII พบว่า ไลบรารี STGมีขนาดของชิ้นดีเอ็นเออินเสิร์ทเฉลี่ย 46 กิโลเบส จำนวน 69,000 โคลน ครอบคลุม3.5 แฮพลอยด์จีโนมมะเขือเทศ ส่วนไลบรารี MTG มีขนาดของชิ้นดีเอ็นเออินเสิร์ทเฉลี่ย85 กิโลเบส จำนวน 110,000 โคลน ครอบคลุม 10.4 แฮพลอยด์จีโนมมะเขือเทศ และไลบรารีCHS มีขนาดของชิ้นดีเอ็นเออินเสิร์ทเฉลี่ย 21 กิโลเบส จำนวน 380,880 โคลน ครอบคลุม8.9 แฮพลอยด์จีโนมมะเขือเทศทั้ง 3 ไลบรารี ใช้การเก็บรักษาโคลนแบบรวมโคโลนี(non-gridded library) โดยเก็บรวบรวมโคโลนี 1,000-5,000 โคลน ต่อหนึ่งชุดตัวอย่าง(pool) เพื่อใช้ตรวจสอบหาโคลนที่สนใจโดยวิธี PCR ร่วมกับ colony hybridizationจากการหาระยะทางทางกายภาพระหว่างดีเอ็นเอ เครื่องหมายที่สัมพันธ์กับยีนต้านทานโรคใบไหม้(~iPh-3~i) จำนวน 3 ตำแหน่ง ได้แก่ TG328 TG591 และ L87 พบว่าตำแหน่งของ TG328และ TG591 มีระยะทางห่างกันไม่เกิน 14 กิโลเบส ส่วนตำแหน่งของ TG591 และ L87มีระยะทางห่างกันไม่เกิน 110 กิโลเบส และเนื่องจากดีเอ็นเอเครื่องหมาย TG328 และTG591 มีตำแหน่งอยู่ใกล้ยีน จึงใช้เป็นดีเอ็นเอเครื่องหมายในการเริ่มต้นทำchromosome walk พบว่าได้โคลนทั้งหมดจำนวน 13 โคลน เมื่อทำแผนที่ทางกายภาพ(physical map) พบว่าครอบคลุมตำแหน่งของดีเอ็นเอเครื่องหมาย TG328 และ TG591รวมเป็นระยะทางกายภาพ 117 กิโลเบส

บรรณานุกรม :
ราตรี บุญเรืองรอด . (2546). การสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่ การหาระยะทางทางกายภาพ และการทำchromosome walk เพื่อแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ในมะเขือเทศ.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
ราตรี บุญเรืองรอด . 2546. "การสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่ การหาระยะทางทางกายภาพ และการทำchromosome walk เพื่อแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ในมะเขือเทศ".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
ราตรี บุญเรืองรอด . "การสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่ การหาระยะทางทางกายภาพ และการทำchromosome walk เพื่อแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ในมะเขือเทศ."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2546. Print.
ราตรี บุญเรืองรอด . การสร้างจีโนมิคดีเอ็นเอไลบรารีขนาดโมเลกุลใหญ่ การหาระยะทางทางกายภาพ และการทำchromosome walk เพื่อแยกสกัดยีนต้านทานโรคใบไหม้ในมะเขือเทศ. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2546.