การฟอกฆ่าเชื้อที่ผิวของเมล็ดโกโก้ด้วยสารละลาย คลอรอกซ์ที่ความเข้มข้น 30 เปอร์เซ็นต์ เป็นเวลา 30 นาที ให้เปอร์เซ็นต์ของเนื้อเยื่อที่ไม่ปนเปื้อนและอัตรารอด ชีวิตสูงสุด เอ็มบริโอเจริญเป็นต้นกล้าเมื่อเพาะเลี้ยง เมล็ดบนอาหารแข็งสูตร MSG2 ที่ไม่มีสารควบคุมการเจริญ เติบโตของพืชตัด แบ่งต้นกล้าโกโก้ และนำไปชักนำแคลลัสใน อาหารสูตร MSG1, MSG2 และ MSG3 พบว่าส่วนเหนือใบเลี้ยง ที่เพาะเลี้ยงในอาหารสูตร MSG3 ที่มี 2,4-D 0.0125 มก/ล ร่วมกับ BA 0.5 มก/ล ให้แคลลัสที่มีลักษณะร่วนฟูสีเหลือง อ่อนจนถึงขาวซีด เมื่อนำส่วนของใบเลี้ยงมาเพาะเลี้ยงอาหารแข็งสูตร MSG1 ที่มีน้ำมะพร้าว 100 มล/ล และ NAA 1.5 มก/ล เป็น เวลา 4 สัปดาห์ แล้วย้ายเลี้ยงในอาหารสูตรเดียวกันที่ไม่ มีน้ำมะพร้าวและ NAA สามารถชักนำการเกิดเอ็มบริออยด์ได้ และเอ็มบริออยด์ที่ได้มีลักษณะเป็นตุ่มสีเขียวผิวเรียบ จากการศึกษาทางกายวิภาคของเอ็มบริออยด์พบว่า เอ็มบริออยด์ที่ได้อยู่ในระยะตอร์ปิโดและมีส่วนที่จะ เจริญไปเป็นใบ, ยอด, กลุ่มท่อลำเลียง และราก คล้าย เอ็มบริโอของพืชใบเลี้ยงคู่โดยทั่วไป นำแคลลัสลักษณะร่วนฟูสีเหลืองอ่อน ไปเลี้ยงเป็นเซลล์ แขวนลอย ในอาหารเหลวสูตร MSG2 ที่มี 2,4-D 0.5 มก/ล ย้าย เลี้ยงทุกๆ 10 วัน ทำการกรองเซลล์แขวนลอยที่ได้หลายๆ ครั้ง จนได้เซลล์แขวนลอยที่มีขนาดสม่ำเสมอ เหมาะสำหรับนำ ไปแยกโปรโตพลาสต์ นำเซลล์แขวนลอยอายุ 6 วัน มาย่อยผนัง เซลล์ โดยใช้สารละลายเอนไซม์ ซึ่งประกอบด้วยเอนไซม์ไดร ซีเลส (Driselase) 2 เปอร์เซ็นต์, น้ำตาลซอร์บิทอล 0.5 โมลาร์, CaCl2, 2H20 มิลลิโมลาร์, MES 1 มิลลิโมลาร์ พีเอช 5.0 นาน 3 ชั่วโมง โดยใช้เซลล์หนัก 0.25 กรัมต่อ สารละลายเอนไซม์ 20 มล. ได้โปรโตพลาสต์ประมาณ 4.5x105 โปรโตพลาสต์/มล ความมีชีวิต 95 เปอร์เซ็นต์ ทดสอบโดยการ ย้อมสีฟลูออเรสซีนไดอะซีเตต เพาะเลี้ยงโปรโตพลาสต์ใน อาหารเหลวสูตร MSG2 ที่มี 2,4-D 0.5 มก/ล น้ำตาลซูโครส 0.5 โมลาร์ ในที่มืดโดยใช้จำนวนโปรโตพลาสต์เริ่มต้น 4x105 โปรโตพลาสต์/มล หลังจากเพาะเลี้ยง 8 วัน พบว่าโปรโตพลาสต์ มีการสร้างผนังเซลล์ใหม่ และมีการแบ่งเซลล์เกิดเป็นกลุ่ม เซลล์เล็กๆ หลังจากเพาะเลี้ยงเป็นเวลา 4 สัปดาห์ จากนั้น นำกลุ่มเซลล์เล็กๆ เหล่านี้มาทำการเพิ่มจำนวนโดยเลี้ยงใน อาหารสูตรเดิมที่มีน้ำตาลซูโครส 0.09 โมลาร์ (3 เปอร์เซ็นต์)