ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การเสาะหา Transposable Element ใน genome ของกุ้งกุลาดำ ~i(Penaeus monodon)~i

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การเสาะหา Transposable Element ใน genome ของกุ้งกุลาดำ ~i(Penaeus monodon)~i
นักวิจัย : อาคม ใสงาม
คำค้น : TRANSPOSABLE ELEMENT , ~iPenaeus monodon~i , ~ihAT~i , ~iMARINER~i
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2542
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=43404
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Transposable element หรือ TE สามารถนำไปใช้เป็นยีนพาหะได้ใน eukaryote หลายชนิด การศึกษา TE ในกุ้งกุลาดำ ~iPenaeus monodon~i อาจเป็นข้อมูลเบื้องต้นในการ พัฒนาใช้ TE เป็นยีนพาหะเพื่อปรับปรุงสายพันธุ์ วัตถุประสงค์ของงานวิจัยคือจำแนกและศึกษา รายละเอียดของ TE ที่มีในกุ้งกุลาดำ กลุ่มของ TE ที่ศึกษามีสองกลุ่ม คือ ~ihobo/Ac/Tam3 (h4T)~i และ ~imariner~i-like element ~i(MLE)~i ซึ่งพบได้ทั่วไปในสิ่งมีชีวิตหลายชนิด โดยใช้เทคนิค PCR ในการตรวจหา และใช้ degenerate primer ที่ออกแบบจาก conserved motifs ของเอนไซม์ transposase โดยในกลุ่มของ ~ih4T~i คือลำดับกรดอะมิโน ~bT(V/M)DMWT~b และ ~bTRWNS~b และกลุ่มของ ~iMLE~i คือ ~bWVPHEL~b และ ~bYSPDLAP~b อย่างไรก็ตามถึงแม้เทคนิค PCR จะสามารถจำแนกและศึกษารายละเอียดของ TE ในคน ~i(Homo sapiens)~i และยุง ~i(Anopheles dirus)~i แต่ไม่สามารถใช้ได้ใน ~iP. monodon~i ผลของ Southern blot hybridization เมื่อใช้ ~imariner sequences~i ของ ~iH.sapeins~i และ ~iA. dirus~i ซึ่งมีความเหมือนของลำดับ นิวคลีโอไดท์ 46% เป็น probe แสดงให้เห็นว่าไม่มีการ cross-hybridization ระหว่าง ~imariner~i ทั้งสองชนิด รวมทั้งไม่สามารถใช้ ~imariner~i sequences ของ ~iH. sapeins~i และ ~iA. dirus~i ในการตรวจสอบ ~imariner~i sequence ใน ~iP.monodon~i อีกด้วย ลำดับนิวคลีโอไทด์ full-length ของ ~imariner~i ใน ~iA.dirus~i ที่ได้จาก PCR โดยใช้ primer เดี่ยว ออกแบบจาก inverted terminal repeat ของ ~imariners~i ซึ่ง conserved ในสิ่งมีชีวิตหลายชนิด มีความเหมือนของลำดับนิวคลีโอไทด์ กับ ~imariner~i ใน ~iC. plorabunda~i ถึง 96% อย่างไรก็ตาม ~imariner~i ของ ~iA.dirus~i ที่ได้ จากงานวิจัยนี้ อาจอยู่ในรูป inactive เพราะมี stop codons, deletions และ frame shifts จำนวนมากในส่วนของ coding sequence และโคลน 2 โคลน คือ PMMAR07 และ PMTE10 ซึ่งได้จาก genomic DNA ของ ~iP. monodon~i โดย PCR จากทั้ง MAR และ TE primers มีความเหมือนกับ ORF2 putative reverse transcriptase ในสิ่งมีชีวิต หลายชนิด ผลของการ hybridization ซึ่งใช้สองโคลนนี้เป็น probe แสดงให้เห็นว่า sequences ทั้งสองมีอยู่เป็นจำนวนหลาย copy ใน genome ของ ~iP.monodon~i จากงานวิจัยนี้สามารถสรุปได้ 2 อย่างคือหนึ่งอาจจะไม่มี TE ในกลุ่ม ~ihAT~i หรือ ~iMLE~i ใน genome ของ ~iP. monodon~i ประการที่สอง ~ihAT~i หรือ ~iMLE~i ใน ~iP. monodon~i อาจมีความแตกต่างอย่างมากกับ ~iH. sapiens~i หรือ ~iA. dirus~i จึงไม่สามารถตรวจสอบโดย PCR หรือ hybridization

บรรณานุกรม :
อาคม ใสงาม . (2542). การเสาะหา Transposable Element ใน genome ของกุ้งกุลาดำ ~i(Penaeus monodon)~i.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
อาคม ใสงาม . 2542. "การเสาะหา Transposable Element ใน genome ของกุ้งกุลาดำ ~i(Penaeus monodon)~i".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
อาคม ใสงาม . "การเสาะหา Transposable Element ใน genome ของกุ้งกุลาดำ ~i(Penaeus monodon)~i."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2542. Print.
อาคม ใสงาม . การเสาะหา Transposable Element ใน genome ของกุ้งกุลาดำ ~i(Penaeus monodon)~i. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2542.