| ชื่อเรื่อง | : | การศึกษา Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ของ HLA class II ในคนไทย |
| นักวิจัย | : | ปานทิพย์ นันทนาวุฒิ |
| คำค้น | : | - |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2540 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=42068 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | จากการที่ได้ทำการตรวจหา HLA class II (DR และ DQ) โดยวิธี restriction fragment length polymorphism (RFLP) ของคนไทยในภาคกลาง 100 ราย (ที่เคยได้รับการตรวจหา HLA ด้วย วิธี serology และ PCR-SSO/SSP มาก่อน) โดยทำการ ตัดย่อย DNA ด้วยเอนไซม์จำเพาะ Taq I นำมาเรียงตัวบนแผ่นวุ้นในสนาม แม่เหล็กไฟฟ้า ถ่ายทอด DNA ลงบนแผ่นไนลอน ทำ hybridization ด้วย HLA-DR(...), -DQ(...) และ -DQ(...) probes แล้ว สร้างภาพบนแผ่นฟิล์ม (Autoradiography) เพื่ออ่านและแปลผล ตามลำดับ ตัวอย่าง DNA ที่ให้รูปแบบของ DR(...) ที่เป็นได้ทั้ง DR(...)7(2)/9 จะถูกนำมาย่อยด้วยเอนไซม์จำเพาะ MspI และ hybridize อีกครั้ง ด้วย HLA-DQ(...) probe เพื่อทำการ แยกแยะโดยอาศัยข้อมูลจาก Taq I digestion ของทั้ง 3 probes ร่วมประกอบการพิจารณา ผลของการศึกษาพบว่าความหลากหลายของ รูปแบบ HLA DNA-RFLP ในคนไทยมีความคล้ายคลึงกับรูปแบบที่พบ ในชาวยุโรปตะวันตก (European Caucasoid) แต่แตกต่างในด้าน ความถี่และความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม (Linkage association) นอกจากนี้ยังพบรูปแบบของ CR(...)-RFLP ที่แตกต่างหรือพบได้ น้อยมากในชาวตะวันตกรวม 3 รูปแบบคือ 1) DB(...)16b-RFLP ซึ่งมีลักษณะแตกต่างจาก DR(...)16 เดิม (เรียกในที่นี้ว่า DR(...)16a) ตามที่เคยมีรายงานในชาวตะวันตกตรงที่มีขนาดของ upper fragment ที่เล็กกว่า (13.0 kb) upper fragment เดิม (14.8 kb) และ พบได้บ่อยกว่ารูปแบบ DR(...)16a (ซึ่งก็เป็นครั้งแรกที่มีรายงาน ในคนเอเซีย) โดยพบได้ในอัตราส่วน 3:1 2) DR(...)12b-RFLP เป็นรูปแบบที่เคยมีรายงานว่าพบน้อยในตะวันตกและเรียกชื่อว่า DR(...)x3 แต่มีรายงานว่าพบบ่อยในชาวจีนใต้โดยมีลักษณะ แตกต่างจาก DR(...)12a ตรงที่มีขนาดของ upper fragment ที่เล็กกว่าคือมีขนาด 11.1 kb แทนขนาด 13.0 kb 3) DR(...)13c เป็นรูปแบบ RFLP ที่ยังไม่เคยมีรายงานมาก่อน และมีความคล้ายคลึง กับรูปแบบ DR(...)11 (ซึ่งประกอบไปด้วย fragments 3 ขนาดคือ 13.0, 6.5 และ 4.2 kb) ต่างกันที่มี lower fragment ขนาด เล็กกว่า 100 bp (หรือ = 4.1 kb) แต่กลับพบสัมพันธ์กับ DRB1*1303 ในอีกมุมมองหนึ่งอาจกล่าวได้ว่าเป็น RFLP ที่สัมพันธ์ กับ DR(...)13b (ซึ่งประกอบไปด้วย fragments ขนาด 11.1, 6.5 และ 4.1 kb) ตามที่เคยมีรายงานมาก่อน ต่างเพียงแต่ว่า มีขนาดของ upper fragment ที่โตกว่า (คือ 13.0 kb) จึงอาจ ถือได้ว่าเป็น variant ของ DR(...)13 โดยให้ชื่อรูปแบบ RFLP นี้ว่า DR(...)13c. ในด้านความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างรูปแบบของ HLA- DR(...)/DQ(...)/DQ(...) RFLP พบมีความแตกต่างจากชาว ตะวันตกอย่างเห็นได้ชัดใน 4 กลุ่มคือกลุ่ม DR(...)15/DR(...)16b, DR(...)12b, DR(...)14b และ DR(...)7(2) เมื่อเปรียบเทียบ วิธีตรวจหาโดย DNA-RFLP กับวิธีของ serology โดยอาศัย PCR-SSO/SSP (PCR-sequence specific oligonucleotides/ sequence specific primers) genotyping เป็นวิธีหลักใน การอ้างอิง จะเห็นได้ว่าการตรวจหาโดยวิธี serology มีผลไม่ สอดคล้องกับ PCR-SSO/SSP ค่อนข้างสูง (5 และ 7 รายสำหรับ HLA-DR และ DQ ตามลำดับ) และยังไม่สามารถยืนยันผลการตรวจพบ HLA-DR และ DQ แอนติเจนในอีก allele หนึ่ง (blank assignment) เป็นจำนวนถึง 3 และ 9 รายตามลำดับ ในขณะที่พบความไม่สอดคล้อง ในวิธีของ DNA-RFLP เพียง 2 ราย (เฉพาะ DR(...)-RFLP) โดยหนึ่งใน 2 รายนี้เป็นรูปแบบที่แตกต่าง (variant) ของ HLA- DR(...)13 ที่ยังไม่เคยมีรายงานมาก่อน ผลการศึกษาครั้งนี้สรุป ได้ว่าการตรวจหา HLA โดยวิธีของ DNA-RFLP สามารถนำมาใช้ ทดแทนการตรวจหาโดยวิธี serology ในประชากรไทยได้ค่อนข้างดี แต่ต้องอาศัยความรู้ด้านความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม (RFLP linkage association) ร่วมกับประสบการณ์และความชำนาญของผู้วิเคราะห์ ในการแปลหรือวินิจฉัยผลที่ถูกต้อง (เช่นเดียวกับการวินิจฉัยผลการ ตรวจโดยวิธี serology แต่ทว่ามีความถูกต้องแม่นยำกว่า) ในกรณี ที่ประสบปัญหาด้านการวินิจฉัยจะต้องอาศัยการตรวจโดยวิธี PCR-SSO/SSP ในการยืนยันความถูกต้อง หรือเมื่อต้องการทราบ ผลการตรจที่จำเพาะของแต่ละ allele |
| บรรณานุกรม | : |
ปานทิพย์ นันทนาวุฒิ . (2540). การศึกษา Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ของ HLA class II ในคนไทย.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ปานทิพย์ นันทนาวุฒิ . 2540. "การศึกษา Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ของ HLA class II ในคนไทย".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. ปานทิพย์ นันทนาวุฒิ . "การศึกษา Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ของ HLA class II ในคนไทย."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2540. Print. ปานทิพย์ นันทนาวุฒิ . การศึกษา Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ของ HLA class II ในคนไทย. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2540.
|
