การศึกษาการจัดกลุ่มของพริกจำนวน 18 accessions 3 สกุลประกอบด้วย Capsicum annuum จำนวน 8 accessions C. frutescens จำนวน 5 accessions และ C. chinense จำนวน 5 accessions โดยใช้เทคนิค Simple Sequence Repeat-Restriction Fragment Length Polymorphism (SSR- RFLP) และ เทคนิค Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) ในการจัดกลุ่มชนิดของ พริก สำหรับเทคนิค SSR-RFLP จัดกลุ่มโดยใช้เอนไซม์ตัดจำเพาะ Dra I และใช้ตัวตรวจสอบชนิด [GATA](,8) พบว่าให้จำนวนแถบดีเอ็นเอทั้งสิ้น 113 แถบ ส่วนเทคนิค AFLP ใช้เอนไซม์ตัดจำเพาะ Eco RI/Tru 9I และไพรเมอร์ในการตรวจสอบ 4 คู่ คือ CAG/CTC, CAG/CAG, CGT/CTC และ CGT/CAG พบว่าให้จำนวนแถบดีเอ็นเอทั้งสิ้น 259 แถบ เปรียบเทียบหาค่าความสัมพันธ์ของแถบดีเอ็นเอ โดยการหาค่า Similarity index (SI) โดยการใช้ค่าสัมประสิทธิ์ 4 ชนิดคือ Jaccard, Dice, Simple matching และ Kulczyski no. 2 และจัดกลุ่มโดยใช้การคำนวณโดยวิธี UPGMA พบว่าข้อมูล ที่ได้จากเทคนิค AFLP สามารถใช้ในการจัดกลุ่มได้ใกล้เคียงกับการจัดจำแนกโดยการใช้ลักษณะ ทางสัณฐานวิทยา ค่า Marker Index (MI) ที่ใช้ในการทดลองนี้ไม่สามารถบอกถึงประสิทธิภาพของ เทคนิคดีเอ็นเอเครื่องหมายได้ เทคนิค SSR-RFLP มีความเหมาะสมในการจำแนกพันธุ์พริกแต่ไม่ สามารถใช้ในการจัดกลุ่มพันธุ์พริกแต่ละชนิดได้