ลุ่มน้ำบางปะกงมีพื้นที่รับน้ำฝนประมาณ 18,807 ตารางกิโลเมตร ประกอบด้วยแม่น้ำ สายสำคัญ 2 สาย คือ แม่น้ำนครนายก และแม่น้ำปราจีนบุรี ลักษณะภูมิประเทศของพื้นที่ต้นน้ำ และพื้นที่ตอนกลางเป็นภูเขาและเป็นที่สูง ส่วนตอนล่างอยู่ภายใต้อิทธิพลจากน้ำขึ้น-น้ำลง ของน้ำทะเล ตัวเมืองสำคัญๆ และพื้นที่เกษตรกรรมที่ตั้งอยู่บริเวณตอนกลางและตอนล่างของ พื้นที่ลุ่มน้ำและอยู่ใกล้กับลำน้ำเช่น อ.กบินทร์บุรี อ.ศรีมหาโพธิ อ.เมืองปราจีนบุรี และ อ.บ้านสร้าง มักจะเกิดปัญหาน้ำท่วมในฤดูน้ำหลากอยู่เสมอ แบบจำลอง MIKE 11 เป็นแบบจำลองทางคณิตศาสตร์สำหรับจำลองการไหลบนผิวดิน และการเคลื่อนตัวของน้ำในลำน้ำ เป็นแบบจำลองอุทกวิทยา-ชลศาสตร์ ในการจำลองสภาพ น้ำท่วมของลุ่มน้ำบางปะกงด้วยแบบจำลอง MIKE 11 ได้ทำการเทียบมาตรฐาน ทั้งการจำลอง สภาพน้ำฝน-น้ำท่า และการจำลองสภาพการไหลในแม่น้ำบางปะกงตอนกลางถึงตอนล่าง ซึ่ง การศึกษาเทียบมาตรฐานแบบจำลองสภาพน้ำฝน-น้ำท่า พบว่า ชลภาพน้ำท่าที่ได้จากการจำลอง และที่เกิดขึ้นจริงที่สถานีวัดน้ำท่า KGT.3 สอดคล้องกันมากที่สุด และมีค่าสัมประสิทธิ์ สหสัมพัทธ์ (r) อยู่ในช่วง 0.76-0.97 ส่วนผลการเทียบมาตรฐานแบบจำลองการเคลื่อนตัว ของน้ำท่วม พบว่าสภาพการไหลและระดับน้ำที่ได้จากการจำลองและที่เกิดขึ้นจริงในแม่น้ำ นครนายก ปราจีนบุรี และบางปะกง มีความสอดคล้องมากที่สุดเมื่อใช้ค่าสัมประสิทธิ์ความ ขรุขระเท่ากับ 0.033 หรือ manning number เท่ากับ 30 ผลการศึกษาความอ่อนไหวของพารามิเตอร์ของแบบจำลองน้ำฝน-น้ำท่า (NAM MODEL) พบค่าความจุผิวดินสูงสุด (U(,max)) ค่าความจุในชั้นดินสูงสุด (L(,max)) ค่าสัมประสิทธิ์ การไหลบนผิวดิน (CQ(,OF)) และค่าพารามิเตอร์ของการเคลื่อนตัวของน้ำ (CK(,1) CK(,2)) จะมีผลต่อการจำลองชลภาพน้ำท่าทั้งค่าอัตราการไหลสูงสุดและปริมาณน้ำท่า โดยเฉพาะค่า CK(,1) CK(,2) จะมีผลต่อเวลาการเกิดน้ำท่าสูงสุด ส่วนผลการศึกษาความอ่อนไหวของ พารามิเตอร์ของแบบจำลองการเคลื่อนตัวของน้ำท่วม (HD-MODEL) พบว่าการลดค่า manning number จะทำให้ค่าระดับน้ำในแม่น้ำสูงขึ้นอย่างเห็นได้ชัด ส่วนการเพิ่มค่า manning number จะทำให้ระดับน้ำลดลงเพียงเล็กน้อย ผลการทำนายระดับน้ำสูงสุดและอัตราการไหลสูงสุดในแม่น้ำบางปะกงสายหลักในลุ่มน้ำ ตอนกลางและตอนล่าง พบว่า ตั้งแต่ที่คาบอุบัติ 25 ปีขึ้นไป ระดับน้ำสูงสุดจะล้นคันกั้นน้ำ ช่วงตั้งแต่อำเภอบางคล้าขึ้นไปจนถึงอำเภอเมืองปราจีนบุรี จากการศึกษาครั้งนี้จะเป็น แนวทางในการวางแผนป้องกันน้ำท่วมและบรรเทาอุทกภัยที่จะเกิดขึ้น และเป็นแนวทาง ในการปรับปรุงแม่น้ำบางปะกงสายหลักในลุ่มน้ำตอนกลางและตอนล่างต่อไป นอกจากนี้ยังได้ จัดทำคู่มือการใช้แบบจำลอง MIKE 11 เพื่อให้สามารถนำไปใช้งานได้โดยสะดวกต่อไป