การควบคุมจุลินทรีย์ด้วยความร้อนเป็นวิธีหนึ่งที่นิยมใช้กันมากและเตา ไมโครเวฟก็เป็นอุปกรณ์ให้ความร้อนที่นิยมใช้กันแพร่หลายในปัจจุบัน จึงได้ทำ การทดลองเกี่ยวกับการใช้ความร้อนจากไมโครเวฟในการทำลายจุลินทรีย์ที่ ปนเปื้อนในอาหารกุ้งแช่แข็ง เพื่อประโยชน์ในการควบคุมจุลินทรีย์ในอาหาร โดยใช้เชื้อ Staphylococcus aureus เป็นจุลินทรีย์ทดสอบเพราะเชื้อนี้ พบว่าอาจปนเปื้อนในอาหารและก่อให้เกิดอาหารเป็นพิษจาก enterotoxin ที่เชื้อสร้างขึ้นได้ จากการทดลองพบว่า ที่อุณหภูมิ -20 องศาเซลเซียส ซึ่ง เป็นอุณหภูมิของกุ้งแช่แข็ง เชื้อจะลดลงในสัปดาห์แรก ๆ เท่านั้น แม้เวลาจะ ผ่านไปถึง 8 สัปดาห์ เชื้อยังมีปริมาณมากอยู่ ดังนั้นหากมีการปนเปื้อนของ เชื้อในอาหารแช่แข็งก็อาจทำอันตรายต่อผู้บริโภคได้ ส่วนผลของความร้อน จากเตาไมโครเวฟต่อการทำลายเชื้อ ในอาหารเหลวพบว่าความร้อนระดับ สูงใช้เวลาน้อยและเชื้อลดลงมาก ความร้อนระดับปานกลางเชื้อลดลงน้อยกว่า ที่ความร้อนระดับต่ำทำลายเชื้อได้น้อยกว่าความร้อนระดับสูงแต่มากกว่า ความร้อนระดับปานกลาง และในการทดสอบในตัวอย่างกุ้งแช่แข็งนั้น ก่อนกุ้ง จะสุกไม่ว่าจะให้ความร้อนระดับใด เชื้อลดลงน้อยมาก และถึงแม้จะให้ ความร้อนจนกุ้งสุกแล้ว ปริมาณเชื้อก็ยังคงใกล้เคียงกับปริมาณเชื้อเริ่มต้น แต่ ถ้าเปรียบเทียบกันแล้วความร้อนระดับต่ำลดปริมาณเชื้อได้มากที่สุด การให้ ความร้อนด้วยไมโครเวฟในตัวอย่างที่เป็นของเหลวจะมีการกระจายความร้อน ได้ทั่วถึงรวดเร็วกว่าตัวอย่างที่เป็นของแข็ง จึงทำให้ทำลายเชื้อได้ดีกว่า แต่ อย่างไรก็ตามพบว่าอาหารที่ทดสอบถึงจะสุกหรือเดือดแล้ว เชื้อยังคงมีปริมาณ เหลืออยู่มาก แสดงให้เห็นว่าการประกอบอาหารด้วยเตาอบไมโครเวฟนั้น แม้ให้ความร้อนจนอาหารสุกและนำมารับประทานได้ แต่ก็ไม่สามารถทำให้ อาหารนั้นปลอดภัยจากเชื้อจุลินทรีย์ที่ปนเปื้อนอยู่ได้ จึงควรเพิ่มความระมัดระ วังในด้านสุขลักษณะความสะอาดของวัตถุดิบที่จะนำมาปรุงอาหารด้วย ไมโครเวฟ เพื่อความปลอดภัยในการบริโภค