| ชื่อเรื่อง | : | การระบุเครื่องหมายเอสเอ็นพีในกุ้งกุลาดำ |
| นักวิจัย | : | อรุณ บัวกลิ่น |
| คำค้น | : | ~iPenaeus monodon~i , GIANT TIGER SHRIMP , SNP , SSCP |
| หน่วยงาน | : | ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2548 |
| อ้างอิง | : | http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1082548000655 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | ค้นหา Single nucleotide polymorphism (SNP) ของยีนในกุ้งกุลาดำ โดยออกแบบไพร์เมอร์จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนที่ค้นหาจากวิธี EST จำนวน 101 ยีน และนำมาทดสอบกับดีเอ็นดีของกุ้งกุลาดำขนาดพ่อแม่พันธุ์ พบว่าสามารถให้ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ได้จำนวนยีนทั้งหมด 48 ยีน เมื่อนำผลิตภัณฑ์ของพีซีอาร์จากยีนต่าง ๆ มาวิเคราะห์รูปแบบทางพันธุกรรมด้วยเทคนิค SSCP พบความแปรผันทางพันธุกรรมใน 44 ยีน จึงทำการเลือกยีนที่มีหน้าที่สำคัญซึ่งประกอบด้วย ribophorin I และ receptor for activated protein kinase ~iC~i(~iRACK~i), defender against cell death 1 (~iDAD1~i) thioredoxin peroxidase และcalponin 1 สำหรับการศึกษาต่อไป โดยทำการเปรียบเทียบผลการทดลองที่ได้จาก SSCP และการลำดับนิวคลีโอไทด์โดยตรงซึ่งพบว่ามีประสิทธิภาพใกล้เคียงกัน จากนั้นทำการประยุกต์วิธีค้นหาSNP ด้วยเทคนิค PCR-RFLP และ PASA ทำการค้นหา full length cDNA ของยีน Ribophorin Iและ ~iRACK~i ด้วยเทคนิค RACE-PCR และพบค้นหา genomic full length ของ ~iDADI~i,thioredoxin peroxidase และ calponin 1 ด้วยวิธี genome walking เพื่อนำมาตรวจสอบ SNPในส่วนของ 5(+,ข) UTR และ 3(+,ข) UTR ตรวจสอบระดับการแสดงออกของยีนในรังไข่และเม็ดเลือดของยีน ribophorin I,~iRACK, DAD1~i, thioredoxin peroxidase และ calponin 1 ในรังไข่และอัณฑะของกุ้งกุลาดำด้วยวิธี semi-quantitative RT-PCR ซึ่งพบความแตกต่างของระดับการแสดงออกของยีนที่ศึกษาของกุ้งกุลาดำวัยเจริญพันธุ์อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (P < 0.05) แต่ไม่พบความแตกต่างของระดับการแสดงออกของยีน ~iRACK~i ในรังไข่และอัณฑะของกุ้งกุลาดำพ่อแม่พันธุ์ ดังนั้นความสัมพันธ์ระหว่าง SNP กับระดับการแสดงออกของยีนดังกล่าวควรพิจารณาแยกกันระหว่างเพศผู้และเพศเมีย ทำการทดสอบผลของอุณหภูมิต่อระดับการแสดงออกของยีนในรังไข่และเม็ดเลือดของกุ้งวัยเจริญพันธุ์ พบความแตกต่างของระดับการแสดงออกของยีน thioredoxin peroxidaseในรังไข่เมื่อเปรียบเทียบกับสภาวะปกติและหลังจากเพิ่มอุณหภูมิ (33 องศาเซลเซียส, 6 ชั่วโมง)เป็นเวลา 6 ชั่วโมง (P<0.05) และความแตกต่างของระดับการแสดงออกของ ~iRACK~i เปรียบเทียบกับกุ้งที่เลี้ยงที่อุณหภูมิปกติหลังจากเพิ่มอุณหภูมิไปแล้วเป็นเวลา 12 ชั่วโมง (P<0.05) จากการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่าง SNP กับระดับการแสดงออกของยีนทั้งในกุ้งขนาดพ่อแม่พันธุ์และกุ้งวัยเจริญพันธุ์ เนื่องจากจำนวนตัวอย่างที่จำกัดทำให้พบจำนวนจีโนไทป์ที่พบเป็นจำนวนมากที่พบในกุ้งเพียงตัวอย่างเดียวทำให้ไม่สามารถตรวจสอบความสัมพันธ์ของจีโนไทป์ดังกล่าวทางสถิติได้ ผลการศึกษาไม่พบความสัมพันธ์ระหว่าง SNP กับระดับการแสดงออกของยีนในตัวอย่างของกุ้งกุลาดำขนาดพ่อแม่พันธุ์และวัยเจริญพันธุ์อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ |
| บรรณานุกรม | : |
อรุณ บัวกลิ่น . (2548). การระบุเครื่องหมายเอสเอ็นพีในกุ้งกุลาดำ.
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. อรุณ บัวกลิ่น . 2548. "การระบุเครื่องหมายเอสเอ็นพีในกุ้งกุลาดำ".
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย. อรุณ บัวกลิ่น . "การระบุเครื่องหมายเอสเอ็นพีในกุ้งกุลาดำ."
กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2548. Print. อรุณ บัวกลิ่น . การระบุเครื่องหมายเอสเอ็นพีในกุ้งกุลาดำ. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2548.
|
