โครงการส่งน้ำและบำรุงรักษาชัณสูตร อันเป็นโครงการหนึ่งในจำนวน 42 แห่งของโครงการชลประทานเจ้าพระยาใหญ่ ครอบคลุมพื้นที่ชลประทาน 5 จังหวัด ได้แก่ ชัยนาทสิงห์บุรี อ่างทอง สุพรรณบุรี และพระนครศรีอยุธยา ซึ่งเป็นพื้นที่ที่มีแนวโน้มการใช้น้ำใต้ดินเพิ่มขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วงที่ประสบปัญหาการขาดแคลนน้ำ จากเหตุการณ์ดังกล่าว เพื่อไม่ให้เกิดปัญหาขาดแคลนน้ำในระยะยาว จึงจำเป็นต้องมีการศึกษาการจำลองสภาพการไหลของน้ำใต้ดิน โดยการใช้โปรแกรม Microsoft SQL Server 2000เป็นระบบฐานข้อมูล และพัฒนาโปรแกรม GWIMMI_CU ขึ้น เพื่อใช้ในการเชื่อมโยงข้อมูลกับแบบจำลองน้ำใต้ดิน โดยใช้โปรแกรม Microsoft Foxpro V6.0 รวมทั้งได้นำโปรแกรมGWIMMI_CU มาใช้ในการจำลองการไหลของน้ำใต้ดิน ในการศึกษาครั้งนี้ ได้พัฒนาระบบฐานข้อมูล ซึ่งมีหน้าที่ใหญ่ๆ 2 ส่วน คือ การจัดการข้อมูลทางด้านทรัพยากรน้ำบาดาล และใช้ในการประเมินอัตราการใช้น้ำใต้ดินและจัดรูปแบบเพื่อนำเข้าโปรแกรม GMS/MODFLOW ซึ่งการพัฒนาระบบครั้งนี้ทำให้ข้อมูลที่จัดเก็บมีรูปแบบและมีมาตรฐานเดียวกัน สามารถใช้งานร่วมกันได้ สำหรับการจัดเตรียมและจัดรูปแบบเพื่อนำเข้าโปรแกรม GMS/MODFLOW สามารถลดระยะเวลาในการจัดเตรียมและมีความยืดหยุ่นในการปรับตัวแปรที่ใช้ในการคำนวณ การจำลองสภาพการไหลน้ำใต้ดินในพื้นที่โครงการส่งน้ำและบำรุงรักษาชัณสูตร ได้ปรับเทียบแบบคงตัวในปี พ.ศ.2542 ปรับเทียบแบบไม่คงตัวในปี พ.ศ.2543-2545 และสอบทานในปี พ.ศ.2532-2545 เมื่อเทียบผลการคำนวณระดับน้ำและอัตราการสูงที่กำหนดทำให้สามารถวิเคราะห์สมดุลของน้ำในพื้นที่ได้ นอกจากนี้ ผลการจำลองสามารถสร้างความสัมพันธ์เชิงเส้นตรงระหว่างระดับน้ำใต้ดินและอัตราการสูบน้ำใต้ดิน ในแต่ละกลุ่มพื้นที่ชลประทานในโครงการส่งน้ำและบำรุงรักษาชัณสูตรได้ อันจะเป็นข้อมูลพื้นฐานในการจัดการน้ำร่วมในพื้นที่ได้ต่อไป