งานวิจัยบทบาทของ www.muslimthai.com ในการปกป้องอุดมการณ์อิสลามนั้นมุ่งศึกษาถึงลักษณะการของ `ญิฮาด' (การต่อสู่เพื่อปกป้องอุดมการณ์อิสลาม) ในระดับการใช้ปากกาหรือคำพูดของเวบมาสเตอร์บนพื้นที่อินเทอร์เนตโดยใช้วิธีการสัมภาษณ์เชิงลึก(Depthlnterview) เวบมาสเตอร์ และวิธีการวิเคราะห์เนื้อหาที่นำเสนอ และบริบททางสังคม(Textual and Contextual Analysis) ในช่วงเวลาตั้งแต่วันที่ 1 ตุลาคม จนถึงวันที่ 30พฤศจิกายน พ.ศ.2544 ผลการวิจัยพบว่าเหตุการณ์วินาศกรรมตึกเวิลด์เทรด 11 กันยายน และสงครามอัฟกานิสถานนั้นส่งผลให้บทบาทของ www.muslimthai.com ในการปกป้องอุดมการณ์อิสลามหรือการ`ญิฮาด' ด้วยคำพูดหรือปากกาของเวบมาสเตอร์นั้นเป็นไปอย่างจำกัด ทั้งนี้เพราะเวบไซต์ได้ถูกสั่งปิดถึงสองครั้งโดยในครั้งที่หนึ่งปิดโดยผู้ให้บริการเครือข่ายสหรัฐอเมริกาโดยไม่ได้บอกเหตุผล และครั้งที่สองถูกปิดโดยผู้ให้บริการเครือข่ายจากสหราชอาณาจักรโดยให้เหตุผลว่า "ปิดเพื่อรักษาความเป็นกลาง" จากเหตุการณ์นี้ชี้ให้เห็นว่าเสรีภาพของอินเทอร์เนตนั้นมีจำกัดทั้งนี้แม้จะมีองค์กร ICANN ซึ่งเป็นผู้ที่ควบคุมอินเทอร์เนต และถูกกำหนดให้มีสถานะเป็นอิสระ แต่หลังจากเกิดเหตุการณ์วินาศกรรม หน่วยงาน FBI ของสหรัฐอเมริกานั้นกลับได้รับอำนาจให้เข้าทำการตรวจสอบ ควบคุมข้อมูลข่าวสารในอินเทอร์เนต และสั่งปิดเวบไซต์ที่ทาง FBI เห็นว่านำเสนอข้อมูลที่เป็นอันตรายต่อสหรัฐอเมริกา อย่างไรก็ตามผู้วิจัยพบว่าถึงแม้จะต้องถูกปิดสองครั้ง เวบมาสเตอร์ก็ได้หันมาใช้ผู้ให้บริการเครือข่ายของไทย และนำเสนอข่าวสารต่อไปในฐานะผู้กรองสาร(Gatekeeper) คนเดียวที่ยึดมั่นในอุดมการณ์อิสลาม และเป็นผู้ที่ไม่ให้ความเชื่อถือกับการนำเสนอข้อมูลข่าวสารของโลกตะวันตกได้ทำการนำเสนอข้อมูลข่าวสารในการต่อสู้เพื่อปกป้องอุดมการณ์อิสลามในสองมิติคือ 1.การ `ญิฮาด' ในเชิงอุดมการณ์ คือการต่อสู้เพื่อปกป้องอุดมการณ์อิสลามโดยการนำเสนอข้อมูลข่าวสารที่ทำให้ผู้อ่านเห็นว่า อุดมการณ์อิสลามนั้นเหนือกว่าอุดมการณ์ทุนนิยมเสรีแห่งโลกตะวันตก เวบมาสเตอร์ยังได้นำเสนอวาทกรรมของโลกใหม่โดยนำเสนอข้อมูลข่าวสารที่ทำให้ผู้อ่านเห็นว่า ยิวไซออนนิสต์เป็นผู้อยู่เบื้องหลังในการทำลายอุดมการณ์อื่นๆ ทั้งหมดที่ขัดกับหลักทุนนิยมโดยใช้โลกตะวันตกที่นำโดยสหรัฐอเมริกาเป็นเครื่องมือ และเนื่องจากเวบไซต์ที่ถูกสั่งปิดให้บริการถึงสองครั้ง ส่งผลให้ตลอดช่วงทำการวิจัยนั้นเวบมาสเตอร์ต้องนำเสนอเนื้อหาเกี่ยวกับอุดมการณ์อิสลามที่ในฐานะที่เป็นอุดมการณ์รอง (Subordinate Ideology) ที่ทำการต่อสู้กับองค์ความรู้ที่เป็นกระแสข่าวสารแห่งอุดมการณ์โลกตะวันตกทุกรูปแบบไม่ว่าจะเป็น การต่อต้าน (Resistant) การต่อรอง(Negotiate) หรือแม้แต่การยอมรับ (Assimilate) เพื่อครองความคิดและจิตใจของชาวมุสลิมในประเทศไทย 2.การ `ญิฮาด' ในเชิงปฏิบัติ คือลักษณะการเผชิญหน้ากับผู้ต่อต้านอิสลามของเวบมาสเตอร์ ในชีวิตจริงนั้นเวบมาสเตอร์จะเผชิญหน้ากับผู้ต่อต้านอิสลามโดยมองว่าสาเหตุของการต่อต้านมาจากการไม่เข้าใจ ดังนั้นการเผชิญหน้าจึงเป็นไปในรูปแบบเชิงสร้างสรรค์และในส่วนของการเผชิญหน้ากับผู้ไม่เข้าใจในอุดมการณ์อิสลามผ่านการนำเสนอข้อมูลข่าวสารนั้น เวบมาสเตอร์นำเสนอข้อมูลข่าวสารทั้งในแบบยึดมั่นถือมั่นอุดมการณ์ของตนแบบถือไพ่เหนือกว่าด้วยข้อเท็จจริง และแบบเชิงสร้างสรรค์ สำหรับบนกระดานเสวนานั้นมีการเผชิญหน้ากันอย่างรุนแรงระหว่างผู้ใช้บริการ และเมื่อพบว่ามีการด่าพระเจ้าทำให้เวบมาสเตอร์ทำการปกป้องอุดมการณ์อิสลามด้วยการสั่งลบข้อความ แต่เมื่อมีการลบข้อความแล้วความรุนแรงยังเกิดขึ้นอีก เวบมาสเตอร์จึงได้ทำการยกเลิก (Censorship) การให้บริการกระดานเสวนาลงระยะหนึ่ง