ทำการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ และกรดอะมิโน ในส่วน C-terminal ของ nucleocapsidprotein gene ของไวรัสไข้หัดสุนัขที่แยกได้ในประเทศไทย จำนวน 13 ตัวอย่าง ที่มีประวัติอายุ อาการป่วยที่แสดงออกระบบต่างๆ รอยโรคทางพยาธิวิทยา การปรากฏ Inclusion bodies การปรากฏแอนติเจนด้วยวิธี Immunohistochemistry และการปรากฏของ RNA ของไวรัสด้วยวิธี RT-PCR เปรียบเทียบกับไวรัสวัคซีน (Onderstepoort strain) และสเตรนอื่นๆ ที่รายงานในGeneBank database (Yanaka, Ueno, Adachi, Hamamatsu และ 2544/Han95) และสเตรนอ้างอิงชนิดรุนแรง (A75/17) ในตำแหน่งเดียวกัน พบว่าในส่วนของลำดับนิวคลีโอไทด์สามารถแบ่งออกได้เป็น 2 กลุ่ม คือ กลุ่มที่มีร้อยละความเหมือนใกล้เคียงกับไวรัสวัคซีน จำนวน 2ตัวอย่าง ที่ 99.10% และ 97.61% ตามลำดับ และกลุ่มที่มีร้อยละความเหมือนใกล้เคียงกับสเตรนอื่นๆ และสเตรนอ้างอิงชนิดรุนแรง จำนวน 11 ตัวอย่าง ที่ 94.63-99.10% สำหรับลำดับของกรดอะมิโนที่อนุมานจากลำดับนิวคลีโอไทด์ สามารถแบ่งได้เป็น 2 กลุ่ม ที่สอดคล้องกันกับกลุ่มที่แบ่งโดยลำดับนิวคลีโอไทด์ โดยเชื้อไวรัสไข้หัด สุนัขที่แยกได้ ไม่พบว่ามีความสัมพันธ์กับประวัติวัคซีน อายุ อาการที่แสดงออกทางระบบต่างๆ และการปรากฏของแอนติเจน