มะเร็งชนิดสความัสเซลล์บริเวณศีรษะและลำคอ พบได้บ่อยเป็นลำดับที่ 6ในกลุ่มประเทศพัฒนาแล้ว โดยส่วนใหญ่บริเวณช่องปาก ริมฝีปาก กล่องเสียง และคอหอย จุดประสงค์ของการศึกษานี้ เพื่อที่จะอธิบายถึงการเปลี่ยนแปลงทางด้านพันธุกรรม ซึ่งมีผลต่อการเกิดมะเร็งชนิดนี้ และเพื่อใช้ความรู้นี้ในการค้นหา molecularmarker ของการเป็นมะเร็ง ความคาดหวังจากการศึกษานี้ คือ นำผลที่ได้มาศึกษาต่อเพื่อเอื้ออำนวยในการวินิจฉัยระยะเริ่มแรกของการเกิดมะเร็งชนิดนี้ และยังอาจจะเป็นประโยชน์ต่อการรักษาโรคนี้โดยการใช้ยาเพื่อการฆ่าทำลายเนื้อเยื่อมะเร็ง ความเป็นไปได้ในการที่จะศึกษาค้นคว้ารูปแบบการแสดงออกของยีน ในแต่ละระยะของโรคมะเร็งบริเวณศีรษะและคอมักจะพบข้อจำกัดจากการที่เซลล์มะเร็งมีการปนเปื้อนกับเนื้อเยื่อปกติ แต่ในปัจจุบัน พัฒนาการของเทคโนโลยีสมัยใหม่ เช่น กล้องจุลทรรศน์ชนิดเลเซอร์ (Laser Capture Microdissection, LCM) ซึ่งมีคุณสมบัติในการแยกเซลล์เฉพาะออกจากเนื้อเยื่อปนเปื้อนอื่น ๆ และนำเซลล์เฉพาะกลุ่มนั้นมาศึกษาการแสดงออกในระดับยีนหรือโปรตีนได้ ดังนั้นการศึกษานี้จึงได้นำกล้องจุลทรรศน์ชนิดเลเซอร์นี้มาทำการตัดแยกกลุ่มเซลล์สความัสเซลล์คาร์ซิโนมา ทั้งที่เป็นเซลล์มะเร็งและเซลล์ปกติจากเนื้อเยื่อที่ได้รับจากผู้ป่วยด้วยโรคมะเร็งชนิดสความัสเซลล์คาร์ซิโนมาบริเวณศีรษะและลำคอ โดยพบว่าการใช้เลเซอร์ในการผ่าตัดแยกเซลล์ประมาณ 5,000 เซลล์นั้นเพียงพอในการสกัด RNA (14.7 - 18.6 นาโนกรัม) เพื่อใช้ในการสังเคราะห์ cDNAprobes และนำไป hybridize กับยีนที่เกี่ยวกับมะเร็งในคน ซึ่งเคลือบอยู่บนเยื่อแผ่น (membrane) จากนั้นนำผลที่ได้ไปเปรียบเทียบกับกลุ่มเซลล์ปกติ ซึ่งการศึกษานี้ พบว่ากลุ่มเซลล์มะเร็งมีการแสดงออกของยีนบางกลุ่ม เช่น cytokeratinsลดลง และมีการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกของยีนในกลุ่มของ signal transductingและ cell cycle regulatory molecular growth และ angiogenic factorsและ matrix degrading proteases นอกจากนั้นยังพบการแสดงออกของยีนในกลุ่ม Wnt และ notch ในกลุ่มเซลล์มะเร็ง ซึ่งอาจจะมีผลต่อการเกิดมะเร็งชนิดสความัสเซลล์คาร์ซิโนมา การทดลองนี้เป็นการนำกล้องจุลทรรศน์ชนิดเลเซอร์มาใช้ในการเริ่มต้นดำเนินการค้นหายีนโดยการสร้าง cDNA Library จากกลุ่มเซลล์มะเร็งศีรษะและลำคอและเซลล์ปกติที่ได้รับจากเนื้อเยื่อที่ได้รับจากผู้ป่วยคนเดียวกัน RNA ที่สกัดได้จะถูกสังเคราะห์เป็น Blunt-ended, double strandcDNA โดยใช้ Oligo (dT) Reverse transcriptions และเพิ่มตัวเชื่อม(Linker) เพื่อทำให้ง่ายต่อการ Transform DNA เข้าสู่แบคทีเรียชนิด pAMP10 แล้วทำการประเมินคุณภาพของ cDNA Library โดยการตรวจลำดับเบส(Sequencing) clones จำนวน 96 clones ที่ได้มาจากการสุ่มตัวอย่างจากทั้ง 6 cDNA Library โดยพบว่า 76-96% ของ Sequencing ที่ได้นั้นเป็น Anonymous ESTs (25-48%) ยีนที่ทราบแล้ว (9-29%) และยีนใหม่(27-51%) โดยมีการซ้ำกันของยีนและ Ribosomal RNA น้อยมาก ซึ่งเป็นตัวบ่งชี้ว่า Library เหล่านี้มีคุณภาพดี และมีการค้นพบยีนตัวใหม่จำนวนมาก ประโยชน์ที่ได้จากการศึกษานี้ คือ การประยุกต์ความรู้ไปค้นคว้าระบบกลไกการทำให้เกิดมะเร็งชนิดสความัสเซลล์คาร์ชิโนมาบริเวณศีรษะและลำคอ ดังนั้น cDNA libraryทั้ง 6 Library นี้จึงถูกนำมาวิเคราะห์โดยการใช้ Bio-Informatic Toolsและพบว่า cDNA Library 6 ชนิด คือ HN7 (normal) และ HN8 (welldifferentiated invasive carcinomas), HN9 (normal) และ HN10(carcinoma ~iin situ~i) HN11 (normal) และ HN12 (moderate topoorly differentiated invasive carcinomas)('*) ประกอบไปด้วยยีนใหม่ที่ไม่เคยรายงาน จำนวน 138 ชนิด ผลที่ได้จากการวิเคราะห์ครั้งนี้ เป็นจุดเริ่มต้นในการที่จะศึกษาถึงรูปแบบเฉพาะของการแสดงออกของยีนในมะเร็งชนิดนี้ในระยะต่าง ๆ ได้ และได้มีการวิเคราะห์เพื่อใช้ในการศึกษาต่อไปโดยการใช้เทคโนโลยีของกล้องจุลทรรศน์ชนิดเลเซอร์ และ high throughput gene arraysซึ่งมีผลต่อข้อมูลที่มีคุณภาพ และเกี่ยวข้องกับการที่จะทำให้เกิดมะเร็งชนิดสควา-มัสเซลล์คาร์ซิโนมาบริเวณศีรษะและลำคอ นอกจากนี้ผลจากการสร้าง cDNALibrary นี้ทำให้มีการค้นพบยีนใหม่อย่างน้อย 189 ชนิด ซึ่งอาจมีผลต่อพยาธิสภาพของมะเร็งชนิดสความัสเซลล์คาร์ซิโนมาบริเวณศีรษะและลำคอ และอาจจะเป็นโมเลกุลตัวใหม่ที่สำคัญสำหรับการวินิจฉัยมะเร็งในระยะเริ่มแรกหรืออาจเกี่ยวข้องต่อการรักษามะเร็งโดยเคมีบำบัดโดยข้อมูลและ DNA clonesที่ได้ทั้งหมดจากการศึกษานี้ ได้มีการเผยแพร่ต่อสาธารณชนเพื่อใช้ในการวิจัยต่อไป