จากการหาวิธีที่เหมาะสมในการทำคานามัยซินที่ผลิตจาก Streptomyces kanamyceticusUUNNK1 ให้บริสุทธิ์ โดยเปรียบเทียบจำนวนครั้งที่ผ่านส่วนน้ำใสที่ได้จากน้ำหมักอาหารเลี้ยงเชื้อลงคอลัมน์ที่มีเรซินแอมเบอร์ไลต์ IRC-50 ในรูปโซเดียม 1 2 และ 3 ครั้ง หลังจากนั้นกำจัดสีด้วยผงถ่านกัมมันต์ และเก็บในรูปตะกอนซัลเฟต พบว่ามีเปอร์เซนต์ความบริสุทธิ์ของคานามัยซินเท่ากับ 63.0 79.2 และ 86.4 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ และปริมาณของคานามัยซินที่ได้เท่ากับ 51.546.8 และ 32.7 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ เมื่อเปรียบเทียบกับปริมาณคานามัยซินในส่วนน้ำใสตั้งต้นคิดเป็น 100 เปอร์เซ็นต์ และภาวะที่เหมาะสมต่อการกำจัดสีของคานามัยซินด้วยผงถ่านกัมมันต์ คืออยู่ในรูปของคานามัยซินซัลเฟต ที่อุณหภูมิ 30 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 30 นาที และปริมาณผงถ่านที่ใช้คือ 0.1-0.2 กรัมต่อ 100 มิลลิลิตร จากการทำโครมาโตกราฟีแบบผิวบาง โดยใช้ส่วนบนของตัวทำละลายที่มีส่วนผสมของคลอโรฟอร์ม : เมธานอล : แอมโมเนียมไฮดรอกไซด์ ด้วยอัตราส่วน 2:1:1 นำมาตรวจสอบแถบด้วยสารละลายนินไฮดริน สามารถแยกสารออกได้แบบเดียว มีลักษณะเป็นหางยาวได้ค่า R1 เท่ากับ0.56 และสารมาตรฐานคานามัยซินเอ ซัลเฟต มีค่า R1 เท่ากับ 0.62 จากการวิเคราะห์โครงสร้างของสารปฏิชีวนะ ด้วยวิธีอินฟราเรด สเปกโตรสโกปี และ นิวเคลียร์แมกเนติค เรโซแนนซ์ พบว่าสารปฏิชีวนะชนิดนี้เป็นอนุพันธ์หนึ่งของคานามัยซิน