ในปัจจุบันนี้ โปรติเอสที่ผลิตโดยบาซิลลัสถูกใช้กันอย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเบียร์ ผงซักฟอก อาหารและ เครื่องหนัง โปรติเอสนั้นสามารถครองสวนแบ่งตลาดได้ประมาณ 60 เปอร์เซ็นต์ ของเอนไซม์ที่มีการซื้อขายกันทั้งหมด โดยที่สองในสามของโปรติเอสถูกผลิตโดยจุลชีพสารอาหารสำหรับการผลิตโปรติเอสที่มีประสิทธิภาพประกอบด้วยแป้งที่ถูกย่อยด้วยเอนไซม์ โปรตีนที่ถูกย่อยสลายแล้ว และแร่ธาตุต่าง ๆ จากการศึกษาการหมักแบบไม่ต่อเนื่องที่อุณหภูมิ37 องศาเซลเซียส ภายใต้อัตราการให้อากาศสูงสุด พบว่าค่าความเป็นกรดด่างและค่าความเข้มข้นเริ่มต้นของกลูโคสที่ได้จากการย่อยสลายแป้ง คือ 7.0 และ 1.8 กรัมต่อลิตรตามลำดับ Bacillus subtilis TISTR 25 มีอัตราการเจริญสูงสุดเท่ากับ 0.52 ต่อชั่วโมง และจะแสดงพฤติกรรมการผลิตโปรติเอสแบบผสมกับอัตราการเจริญเติบโต พบว่า อัตราผลผลิตของโปรติเอสในระบบการหมักแบบต่อเนื่องร่วมกับไมโครฟิลเตรชันน้อยกว่าการหมักแบบไม่ต่อเนื่องเพราะว่า การปรับอัตราการเจือจางสูงสุดไม่สามารถทำได้ ยิ่งไปกว่านั้น เซลล์ที่ถูกกักไว้แก่เกินที่จะผลิตโปรติเอส พบว่าการหมักแบบต่อเนื่องร่วมกับไมโครฟิลเตรชันที่มีการดึงเซลล์ออกสองครั้งสามารถขจัดปัญหาเซลล์แก่ได้บางส่วน และสามารถเพิ่มอัตราผลผลิตของโปรติเอสได้ถึง 1.53 เท่าเมื่อเทียบกับการหมักแบบไม่ต่อเนื่อง