ฐานข้อมูลเพปไทด์ซียูได้รับการพัฒนาขึ้นเพื่อใช้เป็นเครื่องมือสำหรับนักชีวเคมีในการคำนวณและทำนายสมบัติเบื้องต้นของเพปไทด์ เช่น น้ำหนักโมเลกุล ประจุสุทธิของเพปไทด์ที่ความเป็นกรดเป็นด่างต่าง ๆ pl และ hydropathicindex ฐานข้อมูลเพปไทด์ซียูถูกสร้างให้สามารถเข้าถึงโดยผ่านระบบอินเตอร์เน็ต โดยสร้างบนเครื่อง Power Macintosh7100/66 AV และใช้ซอฟท์แวร์ในการสร้าง 4 ซอฟแวร์ ได้แก่FileMaker Pro 3.0. WEB FM, WEBSTAR และ Netscape Navigatorฐานข้อมูลเพปไทด์ซียูประกอบด้วย 971 เรคคอร์ดซึ่งบรรจุข้อมูลของเพปไทด์ทั้ง 971 ชนิด เว็บเพจของฐานข้อมูลนี้มี4 หน้า คือ Introductory page, Search Form page, Resultspage และ Details page ในหน้า Search Form page ผู้ใช้สามารถสืบค้นเพปไทด์อย่างซับซ้อนได้โดยใช้ search operatorและค้นหลาย field พร้อมกัน ในหน้า Details page นั้นนอกจากแสดงข้อมูลของเพปไทด์แล้ว ยังมีส่วนที่ใช้ในการคำนวณน้ำหนักโมเลกุล ประจุสุทธิ และ pl อีกด้วย ซึ่งสามารถคำนวณสมบัติดังกล่าวของเพปไทด์ใดก็ได้ไม่จำเป็นต้องเป็นเพปไทด์ที่อยู่ในฐานข้อมูลนี้ถ้าเพปไทด์นั้นทราบลำดับกรดอะมิโน การคำนวณน้ำหนักโมเลกุลและประจุสุทธิใช้เวลาน้อยกว่า 1 วินาที แต่การคำนวณ pl ใช้เวลา 1 ถึง 10 วินาทีขึ้นอยู่กับขนาดของเพปไทด์ ฐานข้อมูลเพปไทด์ซียูถูกใช้ในการคำนวณ hydropathic index ของเพปไทด์ 3 ตัวเพื่อใช้เปรียบเทียบกับตำแหน่งของลำดับกรดอะมิโนที่ได้จากการสังเกตภาพโครงสร้างสามมิติบนโปรแกรม Rasmol ซึ่งภาพสามมิติเหล่านี้ได้จากการทำ x-ray diffraction ของเพปไทด์