เห็ดหอม (Lentinula edodes (Berk.) Pegler) เป็นเห็ดหอมที่สำคัญทางเศรษฐกิจชนิดหนึ่งของประเทศไทย สายพันธุ์เห็ดหอมที่ใช้เพาะเลี้ยงทางการค้าในปัจจุบันเป็นสายพันธุ์ที่นำเข้ามาจากต่างประเทศดังนั้นจึงมีความจำเป็นในการคัดเลือกและผลิตสายพันธุ์ให้มีความเหมาะสมสำหรับการเพาะเลี้ยงทางการค้า การวิจัยนี้ได้ศึกษาการผันแปรของดีเอ็นเอในเห็ดหอม โดยการจัดกลุ่มเห็ดหอมสายพันธุ์พ่อ-แม่และลูกผสมที่ใช้ทดลองด้วยเทคนิค Restriction Fragment Length Polymorphisms (RFLP(,s))โดยศึกษาแถบดีเอ็นเอที่ได้จากการตัดด้วยเรสทริกชันเอนไซม์และศึกษาแถบดีเอ็นเอที่ได้จากการทำไฮบริไดเซชันกับดีเอ็นเอติดตามที่เตรียมจากชั้นดีเอ็นเอที่มีลำดับเบสซ้ำของสายพันธุ์ MU12 (สายพันธุ์พื้นเมือง) ซึ่งได้จากการโคลนชิ้นส่วนดีเอ็นเอของโครโมโซมเห็ดหอมสายพันธุ์ MU12 ลงในพลาสมิดpUC118 ที่ตำแหน่ง EcoRI ได้ดีเอ็นเอลูกผสม 125 โคลน สุ่มมาทำ Dot-blothybridization กับดีเอ็นเอติดตามที่เตรียมจากโครโมโซมเห็ดหอม MU12 จำนวน59 โคลน เลือกโคลนที่ให้สัญญานการไฮบริไดซ์เข้มได้ 10 โคลน นำไปสกัดเฉพาะชิ้นดีเอ็นเอ insert ได้ชิ้น แล้วทำ Dot-blot hybridization กับดีเอ็นเอติดตามจาก MU12 อีกครั้งหนึ่งเลือกชิ้นดีเอ็นเอ insert ที่ให้สูญญานการไฮบริไดซ์เข้ม ซึ่งคาดว่าเป็นชิ้นดีเอ็นเอที่มีลำดับเบสซ้ำได้3 ชิ้น จากโคลน #50 2 ชิ้นขนาด 5.0 และ 2.0 กิโลเบส และจากโคลน#21 1 ชิ้นขนาด 0.9 กิโลเบสนำไปสร้างเป็นดีเอ็นเอติดตามให้รหัสเป็น*50.1, *50.2 และ *21 ตามลำดับ ผลการทดลองสามารถจัดกลุ่มเห็ดหอมสายพันธุ์พ่อ-แม่ออกจากกันได้ ด้วยการศึกษาแถบดีเอ็นเอที่ได้จากการตัดด้วยเรสทริกซันเอนไซม์ EcoRI, Sau3AI และ TagI และสามารถจัดกลุ่มจากการศึกษาแถบสัญญานการไฮบริไดซ์กับดีเอ็นเอติดตามที่เตรียมขึ้น โดยใช้เอนไซม์และดีเอ็นเอติดตามดังนี้ คือ Haelll/*50.1 (ดีเอ็นเอของโครโมโซมที่ถูกย่อยด้วย Haelll และไฮบริไดซ์กับดีเอ็นเอติดตาม *50.1), Sau3AI/*50.1 โดยรูปแบบของแถบดีเอ็นเอที่เกิดสัญญานการไฮบริไดซ์ของสายพันธุ์ลูกผสม (HY) ส่วนใหญ่จะเกิดจากการผสมกันระหว่างแถบสัญญานของสายพันธุ์พ่อ-แม่ (MU4xMU12)และลักษณะของแถบจะมีความคล้ายคลึงกับสายพันธุ์ MU4มากกว่าสายพันธุ์ MU12 อย่างไรก็ตามในการศึกษาต่อไปจำเป็นต้องเพื่อจำนวนตัวอย่างของสายพันธุ์พ่อ-แม่ และสายพันธุ์ลูกผสมที่ใช้ในการทดลองให้มากขึ้น เพื่อสามารถบ่งบอกการผันแปรของสายพันธุ์เห็ดหอมได้อย่างมีนัยสำคัญ