ความหลากหลายของชนิดและมวลชีวภาพของพันธุ์ไม้น้ำในบึงบอระเพ็ดภายหลังการจัดการเชิงประมง พ.ศ. 2535 โดยทำการศึกษาตั้งแต่เดือนตุลาคม พ.ศ. 2535 ถึงตุลาคม พ.ศ. 2536 ศึกษาจำนวนชนิด, การแพร่กระจายผลผลิตมวลชีวภาพและความสัมพันธ์ของปัจจัยทางสิ่งแวดล้อม และดัชนีความหลากหลาย โดยวิธีการวางแปลงตัวอย่างแบบถาวร ขนาด 1 ตารางเมตรจำนวน 5 แปลงต่อสถานี ในบริเวณ 6 สถานีที่มีสภาพแตกต่างกัน ผลการศึกษาพบพันธุ์ไม้น้ำ 32 ชนิด ใน 22 วงศ์ จำแนกเป็นพืชลอยน้ำ7 ชนิด พืชที่มีใบลอยน้ำ 3 ชนิด พืชใต้น้ำ 5 ชนิด และพืชโผล่พ้นน้ำ 17 ชนิดผลผลิตมวลชีวภาพรวมโดยน้ำหนักแห้งตลอดปี 2194 กรัม/ตารางเมตร ผลผลิตเฉลี่ยต่อเดือนเท่ากับ 182.9 กรัม/ตารางเมตร พืชที่มีใบลอยน้ำจะให้ผลผลิตมวลชีวภาพสูงที่สุด รองลงมาคือพืชลอยน้ำโผล่พ้นน้ำและจมใต้น้ำตามลำดับ การเปลี่ยนแปลงของผลผลิตมวลชีวภาพของพืชลอยน้ำมีความสัมพันธ์ในทางเดียวกันกับความโปร่งใสอุณหภูมิ และมีความสัมพันธ์ในทางตรงกันข้ามกับ pH และแอมโมเนีย อย่างมีนัยสำคัญ (p < 0.05) ส่วนพืชที่มีใบลอยน้ำได้แก่ บัวหลวง มีความสัมพันธ์ในทางเดียวกันกับความโปร่งใสคาร์บอนไดออกไซด์ อุณหภูมิ และไนเตรท และมีความสัมพันธ์ในทางตรงข้ามกับออกซิเจนละลาย pH และแอมโมเนีย สำหรับพืชจมใต้น้ำได้แก่ ดีปลีน้ำมีความสัมพันธ์ในทางเดียวกันกับออกซิเจนละลาย pH แอมโมเนียไนเตรท และฟอสเฟต และสัมพันธ์ในทางตรงกันข้ามกับ ความโปร่งใสและคาร์บอนไดออกไซด์อิสระ ส่วนพืชโผล่พ้นน้ำ คือเอื้องเพ็ดม้า พบว่ามีความสัมพันธ์ในทางเดียวกันกับความลึก สำหรับการแพร่กระจายของพันธุ์ไม้น้ำพบว่า ในบริเวณที่ต้นพืชโผล่พ้นน้ำเช่น กก เอื้องเพ็ดม้า จะมีการแพร่กระจายสูง ส่วนในตอนกลางบึงพบดีปลีน้ำบัวหลวงและสาหร่ายชนิดต่าง ๆ มีการแพร่กระจายสูง