ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การจำแนกชนิดปลาในกลุ่ม Pangasiidae ด้วยเทคนิค PCR-RFLP ของยีน mtDNA 16S rRNA และ nrDNA ITS

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การจำแนกชนิดปลาในกลุ่ม Pangasiidae ด้วยเทคนิค PCR-RFLP ของยีน mtDNA 16S rRNA และ nrDNA ITS
นักวิจัย : เกตุนภัส ศรีไพโรจน์
คำค้น : Pangasianodon , Pangasius , PCR-RFLP , ปลาบึก , ปลาสวาย
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2557
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5280138 , http://research.trf.or.th/node/7484
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ปัจจุบันมีการจำหน่ายผลิตภัณฑ์ของปลาในครอบครัว Pangasiidae อย่างกว้างขวาง การ จำแนกผลิตภัณฑ์เหล่านี้จึงมีความสำคัญ นอกจากนี้การจำแนกลูกปลาวัยอ่อนและลูกผสมโดยการใช้ ลักษณะภายนอกมีข้อจำกัด จึงมีความจำเป็นที่จะต้องพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่สามารถใช้งานง่าย และมีความถูกต้องสำหรับจำแนกชนิดปลาในครอบครัว Pangasiidae เทคนิค Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) ของยีน mtDNA 16s rRNA และ Igm ได้รับการพัฒนาเพื่อจำแนกชนิดปลาในครอบครัว Pangasiidae จำนวน 6 ชนิด การจำแนก ปลาโตเต็มวัยและลูกปลาสามารถทำได้โดยเพิ่มจำนวนดีเอ็นเอ (mtDNA 16s rRNA) ของปลาทั้ง 6 ชนิด โดยใช้ไพรเมอร์ 16Sar และ 16Sbr และนำผลผลิตพีซีอาร์ที่ได้ไปตัดด้วยเอนไซม์ตัดจำเพาะ Tsp509I, HincII และ MfeI เอนไซม์ Tsp509I สามารถจำแนกปลาได้เป็น 2 กลุ่ม และ 2 ชนิด คือ กลุ่ม 1 ปลาบึก และปลาสวาย กลุ่ม 2 ปลาเทโพและปลาเทพา ชนิดที่ 1 คือปลาโมง และชนิดที่ 2 คือปลาสายยู ส่วน เอนไซม์ HincII และ MfeI ใช้จำแนกปลาบึกกับปลาสวายและปลาเทโพกับปลาเทพา ตามลำดับ การ จำแนกลูกผสมทำได้โดยเพิ่มจำนวนดีเอ็นเอ (Igm) โดยใช้ไพรเมอร์ในส่วนของยีน immunoglobulin M heavy chain และนำผลผลิตพีซีอาร์ที่ได้ไปตัดด้วยเอนไซม์ตัดจำเพาะ PstI และ TaqI ลูกผสมระหว่าง ปลาสวายกับปลาบึกและระหว่างปลาสวายกับปลาเทโพสามารถจำแนกได้ด้วยเอนไซม์ TaqI ส่วน ลูกผสมระหว่างปลาสวายกับปลาโมงจำแนกได้ด้วยเอนไซม์ PstI ควรมีการพัฒนาเครื่องหมาย พันธุกรรมสำหรับจำแนกลูกผสมเพิ่มเติมสำหรับการจำแนกลูกผสมที่เกิดจากการผสมกลับกับชนิดพ่อ หรือชนิดแม่ Nowadays, the product of Pangasiids catfishes are distributed worldwide. The authentication of these products is economically important. In addition, the limitation of larvae and hybrid identification base on morphology, the clear and simple molecular markers are needed. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) of the mitochondrial 16S rRNA and nuclear immunoglobulin M heavy chain (Igm) gene were developed for identification of fish, larvae and hybrids of six species in family Pangasiidae. Identification of six Pangasiid species and their larvae was achieved using PCR-RFLP of the mitochondrial 16S rRNA. DNA samples of each of six species and their larvae were amplified using 16Sar and 16Sbr primers and the PCR products were cut with three selected restriction endonucleases (Tsp509I, HincII and MfeI). Tsp509I separates the six species into 2 groups and 2 species (group 1 = P. gigas and P. hypophthalmus, group 2= P. larnaudii and P. sanitwongsei, the first species is P. bocourti, the second species is P. conchophilus). HincII and MfeI could be used to discriminate P. gigas and P. hypophthalmus and P. larnaudii and P. sanitwongsei, respectively. The restriction digest of the PCR product of nuclear Igm gene by enzyme TaqI and PstI allowed the clear distinction of four species (P. gigas, P. hypophthalmus, P. larnaudii and P. bocourti) and their hybrid. Hybrids of P. hypophthalmus x P. gigas and P. hypophthalmus x P. larnaudii could be identified using TaqI. Hybrids of P. hypophthalmus x P. bocourti could be identified using PstI. More molecular marker are a necessity for identification the backcross hybrids.

บรรณานุกรม :
เกตุนภัส ศรีไพโรจน์ . (2557). การจำแนกชนิดปลาในกลุ่ม Pangasiidae ด้วยเทคนิค PCR-RFLP ของยีน mtDNA 16S rRNA และ nrDNA ITS.
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
เกตุนภัส ศรีไพโรจน์ . 2557. "การจำแนกชนิดปลาในกลุ่ม Pangasiidae ด้วยเทคนิค PCR-RFLP ของยีน mtDNA 16S rRNA และ nrDNA ITS".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
เกตุนภัส ศรีไพโรจน์ . "การจำแนกชนิดปลาในกลุ่ม Pangasiidae ด้วยเทคนิค PCR-RFLP ของยีน mtDNA 16S rRNA และ nrDNA ITS."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2557. Print.
เกตุนภัส ศรีไพโรจน์ . การจำแนกชนิดปลาในกลุ่ม Pangasiidae ด้วยเทคนิค PCR-RFLP ของยีน mtDNA 16S rRNA และ nrDNA ITS. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2557.