การศึกษาในครั้งนี้ได้ทำการสำรวจและเก็บตัวอย่างไส้เดือนฝอยรากปม (root-knot nematodes: Meloidogyne spp.) ที่แพร่กระจายในแหล่งปลูกพริกในเขตอำเภอเขื่องในและอำเภอม่วงสามสิบ จังหวัดอุบลราชธานี โดยตัวอย่างของไส้เดือนฝอยรากปมที่ได้ทั้งหมดได้นำมาจำแนกหาชนิด (species) ด้วยวิธีการตัดส่วนก้นและตรวจสอบ perineal pattern ของไส้เดือนฝอย นอกจากนี้ยังได้นำตัวอ่อนระยะที่สอง (second-stage juveniles) ที่ฟักออกมาจากไข่ของตัวเมียที่ได้รับการตรวจสอบ perineal pattern ดังกล่าวไปสกัด DNA และนำเข้าสู่ขบวนการ PCR-RFLP เพื่อตรวจสอบระยะห่างระหว่างยีน cytochrome oxidase subunit II (COII) และ 16S rRNA ในไมโตรครอนเดียของไส้เดือนฝอย ผลการศึกษาจากจำนวนตัวอย่างไส้เดือนฝอยทั้งหมด 250 ตัวอย่าง (จากจำนวนต้นพริก 50 ต้น ครอบคลุมพื้นที่การปลูกพริก 10 ไร่) พบว่า ไส้เดือนฝอยรากปมชนิด M. incognita มีปริมาณสูงสุด (54.8%) รองลงมาคือ ไส้เดือนฝอยรากปมชนิด M. javanica (22%) และ M. arenaria (14%) ตามลำดับ อย่างไรก็ตาม พบว่า 15.2% ของจำนวนตัวอย่างไส้เดือนฝอยทั้งหมดนั้นไม่สามารถบ่งบอกชนิดของไส้เดือนฝอยได้เมื่อตรวจสอบด้วยวิธีการ PCR-RFLP ในส่วนของการเปรียบเทียบชนิดของไส้เดือนฝอยรากปมในเขตที่มีปัญหาการระบาดของไส้เดือนฝอยรากปมอย่างรุนแรงกับเขตที่มีการระบาดไม่รุนแรงนั้น พบว่า ไม่มีความแตกต่างกันในเรื่องของจำนวนชนิด (species) ของไส้เดือนฝอยที่พบ แต่ในเขตที่มีการระบาดรุนแรงพบเปอรเซ็นต์ของไส้เดือนฝอยรากปมชนิด M. incognita และ M. javanica มากกว่าในเขตระบาดไม่รุนแรง นอกจากนี้พบว่า ในเขตที่มีการะบาดไม่รุนแรงนั้นจะพบไส้เดือนฝอยชนิด M. arenaria และ unclassified species มากกว่าในเขตที่มีปัญหาการระบาดของโรครากปมอย่างรุนแรง Molecular identification based on analysis of the DNA between the cytochrome oxidase subunit II gene (COII) and 16S rRNA gene on mitochondrial DNA (mtDNA) of root-knot nematodes, Meloidogyne spp., in chilli using the PCR-RFLP techniques was conducted. Surveys to collect root-knot nematodes from chilli plants grown in Khueang Nai and Muang Samseb District, Ubon Rachathani Province, were performed in the areas of high and low nematode infestations. Of all nematode samples collected from the surveys (250 females from 50 chilli plants in the area of 10 rai), 54.8% were identified as M. incognita (the most prevalent nematode species in Thailand), and 22%, 14%, and 15.2% as M. javanica, M. arenaria, and unidentified species, respectively. M. incognita was the most widespread nematode; infesting all chili plants and all chili fields. In high nematode infestation areas, more M. incognita and M. javanica were found as compared to low nematode infestation fields. M. arenaria and unclassified nematode species, however, existed more extensively in the low nematode infestation fields.