การติดเชื้อไวรัสโรคไข้เลือดออกเป็นปัญหาด้านสาธารณสุขที่สำคัญของไทย เนื่องจากยังไม่มีวัคซีนและยาต้านไวรัสที่ออกฤทธิ์ยับยั้งไวรัสเดงกี่ที่ได้ผล ทำให้มีจำนวนผู้ติดเชื้อและผู้เสียชีวิตในแต่ละปีเป็นจำนวนมาก งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาวิธีการทางคอมพิวเตอร์สำหรับ (1) ออกแบบเปปไตด์เพื่อยับยั้งการทำงานของโปรตีนเอนวีลอปของไวรัสเดงกี่ และ (2) ค้นหายาหรือสารเคมีเพื่อยับยั้งการทำงานของโปรตีนเอนวีลอป, เอ็นเอสสามโปรตีเอส, เฮลิเคสและเอ็นเอสห้าเมทธิลทรานส์เฟอเรสเอสของไวรัสเดงกี่ทั้งสี่ซีโรทัยป์ จากการศึกษาในโครงการนี้ผู้วิจัยได้พัฒนาวิธีการทางคอมพิวเตอร์โดยใช้ genetic algorithm พบว่าสามารถใช้คำนวณเพื่อค้นหาเปปไตด์สายสั้นได้เร็วกว่าวิธี monte carlo simulation ซึ่งเป็นวิธีดั้งเดิม นอกจากนี้ ผู้วิจัยได้พัฒนาวิธีการสกรีนหาสารเคมีเพื่อยับยั้งการทำงานของโปรตีนของไวรัสเดงกี่โดยการใช้วิธีการกรองลิแกนที่มีโครงสร้างที่ไม่เหมาะสมออกจาก screening ligand set ก่อนการสกรีนยาด้วยวิธี virtual screening ทำให้สามารถสกรีนยาจำนวนมากได้รวดเร็วขึ้น ผลการคำนวณพบเปปไตด์และลิแกนที่คาดว่าน่าจะมีฤทธิ์สามารถยับยั้งการทำงานของโปรตีนเอนวีลอป, เอ็นเอสห้าเมท ธิลทรานส์เฟอเรส, เอ็นเอสสามโปรตีเอส, และเฮลิเคสของไวรัสเดงกี่ ซีโรทัยป์ 1, 2, 3 และ 4 ได้ ซึ่งควรได้รับการทดสอบฤทธิ์ดังกล่าวในห้องปฏิบัติการต่อไป Dengue virus infection is an important public health problem in Thailand because there is no effective preventive vaccine and antiviral drugs available for dengue virus inhibition. This results in high rates of infection and death each year. This research aims to develop the computational methods (1) to design peptide inhibitors to inhibit protein functions of dengue envelop and (2) to identify drugs or chemical compounds to inhibit protein functions of envelop, NS3 protease, helicase and NS5 methyltransferase of four dengue serotypes. In this study, we applied genetic algorithm to identify short peptide inhibitors for envelop protein of four dengue serotypes. The result shows that our method is much faster in identifying peptides than the conventional method, i.e. monte carlo simulation. We also developed a new virtual screening method where the ligands with inappropriate structures were removed from the ligand library prior to the screening step. This method substantially shortens the calculation time and could be applied for screening of large ligand library. By using our peptide inhibitor design and virtual screening methods, we could identify potential peptides and chemical compounds that should be further tested against the envelop, NS3 protease, helicase and NS5 methyltransferase of dengue virus serotype 1, 2, 3 and 4 in vitro.