ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การสังเคราะห์และศึกษาสมบัติการจับยึดกับกรดนิวคลีอิกของพิโรลิดีนเพปไทด์นิวคลีอิกแอซิดชนิดใหม่ที่มีสะพานเชื่อมเป็น 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การสังเคราะห์และศึกษาสมบัติการจับยึดกับกรดนิวคลีอิกของพิโรลิดีนเพปไทด์นิวคลีอิกแอซิดชนิดใหม่ที่มีสะพานเชื่อมเป็น 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด
นักวิจัย : จตุรงค์ สุภาพพร้อม
คำค้น : DAPC , DNA , fluorescence , Foldamer , PNA , Pyrrolidine , กรดเบต้าอะมิโน , ดีเอพีซี , ดีเอ็นเอ , พิโรลิดีน , พีเอ็นเอ , ฟลูออเรสเซนต์ , โฟลดาเมอร์ , -amino acid
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2555
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5180025 , http://research.trf.or.th/node/4890
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ในงานวิจัยนี้ได้สังเคราะห์พิโรลิดีนพีเอ็นเอที่มีกรดเบต้าอะมิโนชนิด 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด (APC) เป็นสะพานเชื่อมชนิดใหม่ ซึ่งมีหมู่ไนโตรเจนอิสระที่สามารถดัดแปรหมู่ฟังก์ชันต่างๆ เข้าไปในพีเอ็นเอได้ และศึกษาผลในการแทรกสะพานเชื่อมดังกล่าวต่อสมบัติการจับยึดของพีเอ็นเอกับดีเอ็นเอ โดยคาดว่าการเปลี่ยนสะพานเชื่อมดังกล่าวจะไม่ส่งผลเชิงลบต่อสมบัติการจับยึดกับดีเอ็นเอมากนัก โดยเริ่มจากการสังเคราะห์ (N3-Fmoc/N1-Boc and N3-Fmoc/N1-Tfa) (3R,4S)-APC และ (3S,4R)-APC ตามวิธีในเอกสารอ้างอิง และได้พัฒนาการสังเคราะห์ขึ้นบางส่วน และทำการแทรกสะพานเชื่อมดังกล่าวในพิโรลิดีนพีเอ็นเอระบบเดิมที่มี (1S,2S)-ACPC หลังจากนั้นจึงศึกษาสมบัติการจับยึดกับดีเอ็นเอด้วยเทคนิคต่างๆ ได้แก่ UV-titration, UV-melting temperature และ CD spectroscopy พบว่า พีเอ็นเอที่มีการแทรก (3R,4S)-APC นั้นส่งผลให้ความเสถียรระหว่างสารเชิงซ้อนพีเอ็นเอ-ดีเอ็นเอ ลดลงเล็กน้อย ในขณะที่พีเอ็นเอที่มีการแทรก (3S,4R)-APC นั้นส่งผลให้ความเสถียรระหว่างสารเชิงซ้อนพีเอ็นเอ-ดีเอ็นเอ ลดลงอย่างมาก นอกจากนี้ ยังได้ศึกษาการเพิ่มหมู่ฟลูออเรสเซนต์ 2 ชนิดได้แก่ pyrene-1-carboxylic acid และpyrene-1-butyric acid ไปยังไนโตรเจนบน APC ผ่านพันธะเอไมด์ พบว่าพีเอ็นเอที่ติดฉลากฟลูออเรสเซนต์นั้นสามารถบอกความแตกต่างระหว่างสารเชิงซ้อนพีเอ็นเอ-ดีเอ็นเอแบบคู่สม กับสารเชิงซ้อนที่มีลำดับเบสผิดไป 1 ตำแหน่งได้ด้วยการพิจารณาจากสัญญาณฟลูออเรสเซนต์ที่เปลี่ยนแปลง Conformationally restricted pyrrolidinyl PNAs with an /-dipeptide backbone consisting of a nucleobase-modified proline and a cyclic five-membered amino acid spacer such as (1S,2S)-2-aminocyclopentanecarboxylic acid (ACPC) (acpcPNA) can form very stable hybrids with DNA with high Watson-Crick base pairing specificity. This work aims to explore the effect of incorporating 3-amino-pyrrolidine-4-carboxylic acid (aza-ACPC), which is isosteric to the ACPC spacer, into the acpcPNA. It is expected that the modification should not negatively affect the DNA binding properties, and that the additional nitrogen atom in the aza-ACPC should provide a handle for internal modification. Orthogonally-protected (N3-Fmoc/N1-Boc and N3-Fmoc/N1-Tfa) aza-ACPC monomers have been successfully synthesized and incorporated into the acpcPNA by Fmoc-solid-phase peptide synthesis. Tm, UV and CD spectroscopy confirmed that the (3R,4S)-aza-ACPC could substitute the (1S,2S)-ACPC spacer in the acpcPNA with only slightly decreasing the stability of the hybrids formed between the modified acpcPNA and DNA. In contrast, the (3S,4R) enantiomer of aza-ACPC caused substantial destabilization of the hybrids. Furthermore, a successful on-solid-support internal labeling of the modified acpcPNA via amide bond formation between pyrene-1-carboxylic acid or pyrene-1-butyric acid and the pyrrolidine nitrogen atom of aza-ACPC spacer has been demonstrated. Fluorescence properties of the pyrene-labeled acpcPNA are sensitive to its hybridization state and can readily distinguish between complementary and single-mismatched DNA targets.

บรรณานุกรม :
จตุรงค์ สุภาพพร้อม . (2555). การสังเคราะห์และศึกษาสมบัติการจับยึดกับกรดนิวคลีอิกของพิโรลิดีนเพปไทด์นิวคลีอิกแอซิดชนิดใหม่ที่มีสะพานเชื่อมเป็น 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด.
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
จตุรงค์ สุภาพพร้อม . 2555. "การสังเคราะห์และศึกษาสมบัติการจับยึดกับกรดนิวคลีอิกของพิโรลิดีนเพปไทด์นิวคลีอิกแอซิดชนิดใหม่ที่มีสะพานเชื่อมเป็น 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
จตุรงค์ สุภาพพร้อม . "การสังเคราะห์และศึกษาสมบัติการจับยึดกับกรดนิวคลีอิกของพิโรลิดีนเพปไทด์นิวคลีอิกแอซิดชนิดใหม่ที่มีสะพานเชื่อมเป็น 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2555. Print.
จตุรงค์ สุภาพพร้อม . การสังเคราะห์และศึกษาสมบัติการจับยึดกับกรดนิวคลีอิกของพิโรลิดีนเพปไทด์นิวคลีอิกแอซิดชนิดใหม่ที่มีสะพานเชื่อมเป็น 3-อะมิโนพิโรลิดีน-4-คาร์บอกซิลิกแอซิด. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2555.