การประเมินผลกระทบของชุดโครงการค้างคาวและโรคพิษสุนัขบ้า เพื่อประเมินผลงานทางวิชาการทั้งส่วนที่เป็นผลผลิตและผลลัพธ์ของโครงการและเพื่อประเมินผลกระทบเบื้องต้นของโครงการในเชิงการป้องกัน การรักษา ในระดับประเทศและระดับนานาชาติ ทั้งในแง่ของนโยบายและการนำไปปฏิบัติ พบว่าผลงานวิจัยที่เกิดขึ้นจากชุดโครงการค้างคาวและโรคพิษสุนัขบ้า เป็นผลงานวิจัยที่ดีมาก มีศักยภาพ ก่อให้เกิดประโยชน์ทางด้านการแพทย์ การสาธารณสุขของประเทศ องค์ความรู้ที่ได้จากงานวิจัยและเทคนิคการตรวจสอบอณูชีววิทยาที่ได้พัฒนาขึ้น ทำให้การตรวจวินิจฉัยโรคมีความแม่นยำขึ้น มีประโยชน์ในการติดตามการกระจายไวรัสพิษสุนัขบ้าในพื้นที่ต่าง ๆ ข้อมูลการพบเชื้อไวรัสนิปาห์ในค้างคาวไทย ซึ่งเป็นข้อมูลที่พบใหม่ในประเทศไทย เป็นการกระตุ้นเตือนหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในการวางมาตรการป้องกันการเผยแพร่โรคจากค้างคาวมาสู่คนและสัตว์อื่น ๆ ส่วนการนำผลงานวิจัยไปใช้ในเชิงปฏิบัติในช่วงระยะแรก ๆ นั้นอาจจะยังไม่มีการนำผลงานวิจัยไปใช้มากนักจะต้องอาศัยระยะเวลา ดังนั้นจึงมีความจำเป็นจะต้องมีการเผยแพร่ผลงานวิจัยต่อสาธารณชนอย่างต่อเนื่อง ในส่วนของการศึกษาโรคสมองอักเสบอุบัติใหม่ที่เกิดจากไวรัสในค้างคาวไทยซึ่งเป็นงานวิจัยที่มีประโยชน์ หากได้มีการศึกษาต่อยอดคาดว่าน่าจะมีประโยชน์มากขึ้น