แมลงริ้นดำเป็นพาหะของโรคและศัตรูที่สำคัญในมนุษย์และในสัตว์ ดังนั้นการระบุสปีชีส์อย่างถูกต้องแม่นยำจึงมีความจำเป็นสำหรับการศึกษาด้านอื่นๆ การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้เครื่องหมายพันธุกรรมระดับพันธุศาสตร์โมเลกุลเพื่อตรวจสอบความแตกต่างระหว่าง cytoforms ของแมลงริ้นดำสปีชีส์ซับซ้อน Simulium siamense และ S. angulistylum และแมลงริ้นดำกลุ่มสปีชีส์ S. striatum ในประเทศไทย ได้แก่ S. quinquestriatum, S. chiangmaiense และ S. nakhonense ผลการศึกษาโดยใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน cytochrome c oxidase subunit I (COI), NADH dehydrogenase subunit 4 (ND4) และ elongation complex protein 1 (ECP1) พบว่ายีน COI ส่วนที่ใช้ศึกษาดีเอ็นเอบาร์โค้ดไม่สามารถจำแนก cytoforms ของ S. siamense, S. angulistylum และสปีชีส์ภายในกลุ่มสปีชีส์ S. striatum ได้ ขณะที่ยีน ND4 สามารถแยก cytoform B ของแมลงริ้นดำ S. siamense และ cytoform C ของแมลงริ้นดำ S. angulistylum จาก cytoforms อื่นๆ ได้ ยีน ECP1 สามารถแยกความแตกต่างระหว่าง S. quinquestriatum กับ S. nakhonense และ S. chiangmaiense ได้ แต่ไม่สามารถระบุความแตกต่างระหว่าง S. nakhonense กับ S. chiangmaiense การศึกษาสัณฐานวิทยา พันธุศาสตร์เซลล์ และนิเวศวิทยาไม่พบความแตกต่างระหว่าง S. nakhonense และ S. chiangmaiense เช่นกัน ดังนั้นจึงสรุปว่าทั้ง 2 สปีชีส์เป็นสปีชีส์เดียวกันทางชีววิทยา โดย S. chiangmaiense เป็นชื่อพ้องของ S. nakhonense คำสำคัญ: แมลงริ้นดำ, ความแปรผันทางพันธุกรรม, สปีชีส์ซับซ้อน